回答編集履歴
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追加情報を加味した回答を追記
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@@ -63,4 +63,33 @@
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どうしても改善できない場合、苦肉の策として、Javascriptなどを使って問題のデータを非同期で取得する、とかでしょうか。。
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ちなみに、ご提示のクエリだとペットを飼っている人が１人もいない趣味は結果に含まれないことになりますが、
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それは問題ないでしょうか？
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それは問題ないでしょうか？
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+
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+
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`FORCE INDEX`が聞いたということでしたら、以下２通りのクエリを試していただけますでしょうか？
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+
```sql
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SELECT t_syumi.syumi_id, t_syumi.syumi_name, tmp.cnt
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+
FROM t_syumi
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+
INNER JOIN (
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+
SELECT syumi_id, COUNT(DISTINCT pet_name) AS cnt
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+
FROM t_petlist
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+
FORCE INDEX FOR GROUP BY (pet_name)
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+
INNER JOIN t_setting ON t_setting.user_id = t_petlist.user_id
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+
GROUP BY syumi_id
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+
) AS tmp ON t_syumi.syumi_id = tmp.syumi_id
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+
ORDER BY cnt DESC;
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```
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+
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```sql
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SELECT t_syumi.syumi_id, t_syumi.syumi_name, tmp.cnt
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+
FROM t_syumi
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+
INNER JOIN (
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+
SELECT syumi_id, COUNT(DISTINCT pet_name) AS cnt
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+
FROM t_setting
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+
FORCE INDEX FOR GROUP BY (syumi_id)
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+
INNER JOIN t_petlist ON t_setting.user_id = t_petlist.user_id
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+
GROUP BY syumi_id
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+
) AS tmp ON t_syumi.syumi_id = tmp.syumi_id
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+
ORDER BY cnt DESC;
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```
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回答を追記
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@@ -1,4 +1,66 @@
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問題が`DISTINCT`句であることが特定できているようですので、以下のページが参考になるかもしれません。
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[https://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/ja/distinct-optimization.html](https://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/ja/distinct-optimization.html)
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また、"情報の追加・修正の依頼をする"欄に記載させていただいた情報を追記いただけると、より詳しい状況がわかるので、具体的な回答を得やすくなると思います。
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また、"情報の追加・修正の依頼をする"欄に記載させていただいた情報を追記いただけると、より詳しい状況がわかるので、具体的な回答を得やすくなると思います。
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情報の追記、ありがとうございます。
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一見したところ、インデックスのつけ方は問題ないように見受けます。
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こちらで15万件ものデータを投入した環境を用意することができないので、
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以下に、同様の結果を得られ（ると思う）、かつパフォーマンスの改善が見込めそうなクエリを
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いくつか挙げさせていただきます。
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#### ケース1 : JOINする順番を変更（レコードの少ないテーブルからJOIN）
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```sql
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SELECT t_syumi.syumi_id, syumi_name, COUNT(DISTINCT pet_id) AS cnt
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+
FROM t_syumi INNER JOIN t_setting ON t_syumi.syumi_id = t_setting.syumi_id
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+
INNER JOIN t_petlist ON t_setting.user_id = t_petlist.user_id
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+
GROUP BY t_syumi.syumi_id
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ORDER BY cnt DESC
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;
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```
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+
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#### ケース2 : ケース1に加えて、`DISTINCT`句を排除
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```sql
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SELECT t_syumi.syumi_id, syumi_name, COUNT(pet_id) AS cnt
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+
FROM t_syumi
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INNER JOIN t_setting ON t_syumi.syumi_id = t_setting.syumi_id
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+
INNER JOIN t_petlist ON t_setting.user_id = t_petlist.user_id
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+
GROUP BY t_syumi.syumi_id
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ORDER BY cnt DESC
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;
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```
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#### ケース3 : ケース2に加えて、レコード数を絞り込んでからJOIN（hirohiro様の回答と同様）
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```sql
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+
SELECT t_syumi.syumi_id, syumi_name, cnt
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+
FROM t_syumi INNER JOIN (
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+
SELECT syumi_id, COUNT(*) AS cnt FROM t_setting
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INNER JOIN t_petlist ON t_setting.user_id = t_petlist.user_id
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+
GROUP BY syumi_id
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+
) AS tmp ON t_syumi.syumi_id = tmp.syumi_id
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ORDER BY cnt DESC
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+
;
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```
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#### ケース4 : ケース3に加えて、`FORCE INDEX`句を使用
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[https://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/ja/index-hints.html](https://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/ja/index-hints.html)
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```sql
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SELECT t_syumi.syumi_id, syumi_name, cnt
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FROM t_syumi INNER JOIN (
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SELECT syumi_id, COUNT(*) AS cnt FROM t_setting
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FORCE INDEX FOR GROUP BY (syumi_id)
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+
INNER JOIN t_petlist ON t_setting.user_id = t_petlist.user_id
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GROUP BY syumi_id
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) AS tmp ON t_syumi.syumi_id = tmp.syumi_id
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ORDER BY cnt DESC
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;
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どうしても改善できない場合、苦肉の策として、Javascriptなどを使って問題のデータを非同期で取得する、とかでしょうか。。
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ちなみに、ご提示のクエリだとペットを飼っている人が１人もいない趣味は結果に含まれないことになりますが、
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