回答編集履歴
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設定について追記しました。あとはちょっとわからないですが...。
test
CHANGED
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Rails アプリケーション側でこの環境変数を利用すると思うのですが、ソースコード側はどうなっているでしょうか？
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database.yml とか redis.yml とか sidekiq の設定ファイル関連を見てみるると良いのでは。
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### 追記
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docker-compose 以外の環境では、このアプリケーションは実行されてはいない状況でしょうか？
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（ローカル開発環境で、直接RailsやMySQLを動かす形）
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あと、DBのレプリケーションをする際は、コネクションモデルのカスタマイズが必要な気がします。
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それを行っていないのだとすると、データーベースは development モードの標準の設定（直下の設定）を見るような気がします。
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まずは、ご提示いただいた development の設定のところを、
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primary_replica:
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ではなくて、以下ではどうでしょう？
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(1) primary, primary_replicaを外して、development 直下に設定を書く。
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development:
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database: development
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(2) あるいは、primary, primary_replicaを残しつつ、development 直下に設定を書く。
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development:
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primary_replica:
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