回答編集履歴
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追記
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@@ -8,9 +8,12 @@
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また、phpinfo()でmysqliが使えることを確認してみてください。
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（使えない状態であればインストールしてください。）
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あとは
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[MySQL Server 8.0からデフォルトの認証方式が変更。MySQLiやPDOではまだ扱えないため要注意。](https://yoku0825.blogspot.com/2018/01/mysql-804.html)
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あたりもありそう（後述のログを確認すればこの辺の切り分けも出来ます）
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これで解決しない場合は、もう少し切り分けが必要かなと思います。
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ログの確認と切り分け
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修正
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@@ -1,7 +1,7 @@
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通常は指定しなければデフォルトのポートで繋がる気がしますが、
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`$cfg['Servers'][$i]['port'] = '3306';`(結構古いバージョンにしか存在しないオプション)
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もしくは
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`$cfg['Servers'][$i]['host'] = '
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`$cfg['Servers'][$i]['host'] = 'MySQL側のIP:3306';`
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を明示的に指定するとどうなりますかね？
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