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  create-react-appはwebpackを元に開発環境がパッケージされています。

  試しにcreate-react-appで新しいプロジェクトを作って```npm run eject```を打ってみると分かりやすいと思います。(※ejectしたあとは元に戻せないので新しいプロジェクトで試すことをお勧めします)

  いろいろと設定ファイルがあらわになります。

  Reactアプリをさくっと作成するための設定がwebpackにてあらかじめされているため、アプリケーションbuild時にindex.htmlでJavaScriptを呼び出せています。