回答編集履歴
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恐れ入りますが、回答を再修正しました。
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VSCODEも、pyenvも 一度uninstallしてから、（公式のpythonも一度uninstallしたほうが良いです）
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~~VSCODEも、pyenvも 一度uninstallしてから、（公式のpythonも一度uninstallしたほうが良いです）
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環境を再構築すれば良いです。
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環境を再構築すれば良いです。~~
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再修正：
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pyenvでインストールしたpythonをuninstallしてください。
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それで解決しないのであれば、公式のpythonもinstallし直してみてください。
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質問者のコメントを得て、回答内容を修正しました。
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@@ -1,13 +1,15 @@
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意図しているのは、こういうことでしょうか？
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~~意図しているのは、こういうことでしょうか？
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[【Python3×VSCode】実行環境を分ける必要が出たら行う手順（仮想環境作成）](https://qiita.com/some-nyan/items/7f20fa5fa0b6e451a42b)
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[https://qiita.com/Yuto-Igarashi/items/f674d6b73057fd6a2f17](https://qiita.com/some-nyan/items/7f20fa5fa0b6e451a42b)
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それとも、pyenvからインストールしたものを辞めて（uninstallして）、公式からインストールしたpythonを使いたいということでしょうか？~~
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VSCODEも、pyenvも 一度uninstallしてから、（公式のpythonも一度uninstallしたほうが良いです）
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環境を再構築すれば良いです。
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