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  詳しくはわかりませんが、NAS の内部でハードディスクが実際にどのファイルシステムでフォーマットされているか、と、samba/NFS などのネットワークストレージ用プロトコルが何であるか、とは一応別のものですよね。もちろん、後者で提供できる機能は前者に制限されるところはあるわけですが。

  たとえば USB 接続の外付けハードディスクの場合は直接ファイルシステムにアクセスするので Mac だと NTFS にアクセスできない、とかあるわけですが、NAS ということは、直接ファイルシステムにアクセスしているのは NAS を動かしている OS 上のプロセスなわけですよね。