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  どちらも隙間の設定ですが、marginはborderの外側、paddingはborderの内側なので、borderを使う場合には明確な違いがあります。

 

  また、背景色を設定するときに、padding(やborderの裏)にはその要素の背景色が付き、marginには付かない(親要素の背景色が付く)という違いもあります。