回答編集履歴
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保存・読み出しのコードの提示をお願いしていますか、おそらく以下が原因と思います。
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jpegフォーマットは非可逆ですので、保存して読み出すと元とは異なる可能性があります。そのため、特に、最頻値といったナイーブな（画像の少しの変化に影響されやすい）数値統計結果は、元とは異なる可能性が高いです。
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一方、pngやtiffフォーマットは可逆ですので、このようなことは発生しません。
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