回答編集履歴
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方法について補足
answer
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@@ -1,5 +1,6 @@
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「要らない物が画像の外周部に出てくる」とわかっている状況なのであれば，
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外周を含む領域を棄却すれば良いだけに思えますが，そういう話ではない？
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（簡単には，白色で画像の外周に沿う幅1pixelの矩形を描画してやって，そこを黒色でFloodFillしてやれば，外周に接する不要領域を巻き込んで黒にできる（外周から1画素だけ離れてたやつも巻き込まれるけどね））
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あと，（元画像が不明なので何とも言えませんが）
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外周部に要らん物が残ったり，２値画像に対してやたらでかいMedianフィルタを使ったりとかすることになった要因というのが
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