回答編集履歴
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+sample code
test
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group_byを利用すればIDごとの最大scoreを求めることが出来るので、これに基づき、元データフレームからID,最大scoreに合致するものを普通に抽出すればいいのでは。
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ソース例追記:
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x %>% group_by(ID) %>% summarize(max_score=max(score)) -> x2
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x[x$score==x2[x$ID,"max_score"],]
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