回答編集履歴
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追記
test
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おっしゃる通り、CentOSのインストールを進めていくと、どこかのタイミングでパーティションを削除するかの選択肢が出るはずです。
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追記：
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CentOS7の場合ですが、次のリンク先にパーティションを削除する手順が載っています。
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[カスタムOSインストールガイド - CentOS7](https://help.sakura.ad.jp/app/answers/detail/a_id/2397/~/%E3%82%AB%E3%82%B9%E3%82%BF%E3%83%A0os%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%82%B9%E3%83%88%E3%83%BC%E3%83%AB%E3%82%AC%E3%82%A4%E3%83%89---centos7-%2F-scientificlinux7)
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