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コードを拝見すると、ブラウザがHTMLを読み込む際に、jqueryやd3などが取得できていない状態でjsが実行されることによるエラーではないかと想像しています。ブラウザの開発コンソールでjsエラーがないかを確認してください。
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よくある対策としては、jqueryの`$(document).ready()`を使います。
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ブラウザの開発コンソールでjsエラーがないかをご確認してください。
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https://learn.jquery.com/using-jquery-core/document-ready/
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