回答編集履歴
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[read(byte[] b, int off, int len)](https://docs.oracle.com/javase/jp/8/docs/api/javax/sound/sampled/AudioInputStream.html#read-byte:A-int-int-) のほうには明示的にブロックとは書いていませんが,
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> オーディオ・ストリームから指定されたデータの最大バイト数まで読み込み、読み込んだバイトを指定されたバイト配列に格納します。
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とあり, 最大まで読み込むとあったり, read(byte[] b) → read(byte[] b,0,b.length) という呼び出しの連鎖になっている場合が多いため, ブロックするものと推測します. (ソースは確認していません.)
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Swing はシングルスレッドですので, actionPerformed 内でブロックすれば, 再描画を含めた全体が止まります.
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そして, sys.startrec が終わって actionPerformed を抜ければ動き出しますが, その時バッファ(recordsys.wavedata) には最後の 1 秒分のデータしかありません.
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改行修正
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「開始」ボタンで actionPerformed から呼ばれる sys.startrec メソッド内で実行される
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「開始」ボタンで actionPerformed から呼ばれる sys.startrec メソッド内で実行される AudioInputStream#read によって, 計 5 秒ブロックしているものと思います.
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AudioInputStream#read によって, 計 5 秒ブロックしているものと思います.
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