回答編集履歴
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Windows であれば、Media Control Interface も用意されています。
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Windows であれば、Media Control Interface も用意されています。コーデックの用意はどこまで可能かわかりませんが...
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単純にファイルデータをmバイト目からnバイト目までにぶった切ったりしても、M秒目からN秒間の動画になりませんし、コーデックの種類や動画の仕様（キーフレームの挿入頻度、ビットレートそのほか）は多種多様なので、餅は餅屋で任せます。でなければ、相当高度なコードを書くことになるでしょう。
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もしマッチしたライブラリがあればラッキーです。
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[https://msdn.microsoft.com/en-us/library/windows/desktop/dd756808.aspx](https://msdn.microsoft.com/en-us/library/windows/desktop/dd756808.aspx)
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[http://codezine.jp/article/detail/210](http://codezine.jp/article/detail/210)
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[https://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/cc353899.aspx](https://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/cc353899.aspx)
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Java向けに"Java Media Framework API"なるものも存在するようです。試したことはありませんが、これであればUnix系のサーバでも使えそうです。
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[https://ja.wikipedia.org/wiki/Java_Media_Framework](https://ja.wikipedia.org/wiki/Java_Media_Framework)
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[http://d.hatena.ne.jp/Guernsey/20090713/1247493375](http://d.hatena.ne.jp/Guernsey/20090713/1247493375)
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