回答編集履歴
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他の確認方法を追記
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今回の場合は、MySQLサーバからの接続対象となるのはメインサーバになるので、「db_user@メインサーバ」(もしくは、メインサーバを含むフィルタリング)になるはずです。
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とりあえずユーザも確認されたほうがよろしいのではないでしょうか。
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そろそろ、自分もお手上げの状態になってきましたね。
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とりあえず、①が正しいやり方のはずです。
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(もっとも、私も間違いがあるかもしれませんので、適度に疑ってください)
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もし可能であれば、MySQLではなく、httpなどの他のサービスで試してみるのも手でしょう。
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mysql.connectorについて。
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* [Python3でMySQL Connectorのインストール・接続方法【快適に使う方法を紹介】](https://basicincome30.com/python3-mysql-connector)
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上記サイトによると、mysql.connectorと言っても、色々と派生があるようです。
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試しに自分のところのpipで確認したところ、
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mysql-connector (2.1.6) - MySQL driver written in Python
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bottle-mysql-connector (0.0.4) - MySQL integration for Bottle.
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mysql-connector-python (8.0.13) - MySQL driver written in Python
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mysql-connector-repackaged (0.3.1) - MySQL driver written in Python
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mysql-connector-async-dd (2.0.2) - mysql async connection
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mysql-connector-python-rf (2.2.2) - MySQL driver written in Python
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mysql-connector-python-dd (2.0.2) - MySQL driver written in Python
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py_mysql_connector (0.1) - MySQL database connector
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というようになっています。
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とりあえずうまくいっているというメインサーバのパッケージと見比べてみてあわせてみたり、他のパッケージを試してみてはいかがでしょうか。
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また、mysql-connector-pythonの場合、パッケージのバージョンとMySQLのバージョンとの組み合わせもあるようです。
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そこも確認してみてください。
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もし可能であれば、pythonスクリプトではなく、sshコマンド+mysqlコマンドで試してみるのも手です。
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MySQLのユーザに関して追記
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上記でもダメでしょうか。
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「MySQLのユーザ設定から拒否されている」とは、「Access denied for user」でしょうか。
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エラーメッセージは、出たままを伝えてください。
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とりあえず、sshコマンドでメインサーバに接続し、メインサーバ上でmysqlコマンドを実行してみてください。
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mysql -u db_user -h MySQLサーバ -p
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上記のコマンドでパスワードを入力しても同様のエラーが出るようであれば、sshの問題ではありません。
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MySQLもちょこっと触った程度なのであまり知りませんが、MySQLのユーザは、ユーザ名・ホストで管理されており、ホストはアクセス権限になっているそうです。
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* [MySQLの使い方 - ユーザの作成](https://www.dbonline.jp/mysql/user/index1.html)
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今回の場合は、MySQLサーバからの接続対象となるのはメインサーバになるので、「db_user@メインサーバ」(もしくは、メインサーバを含むフィルタリング)になるはずです。
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とりあえずユーザも確認されたほうがよろしいのではないでしょうか。
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ポート番号の指定について追記
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「host」の部分で指定するのがデータベースサーバのホストであれば、これではトンネルを使わずに直に接続しにいってます。
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トンネルを使うのであれば、トンネルの入り口である「localhost」を指定すべきではないでしょうか。
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上記のやり方ではダメだったそうですが、もう一点確認していただきたい。
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* [Python 3.6 から MySQL データベースへ SSH 接続を試みる](http://pickles-ochazuke.hatenablog.com/entry/2017/12/10/160816)
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上記によると、ポート番号も指定する必要があるらしいです。
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```python
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config = {
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"user": "db_user",
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"host": "localhost",
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"port": ssh.local_bind_port,
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"password": "db_password"
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}
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上記でもダメでしょうか。
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