回答編集履歴
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追記
test
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numpyのboolean maskやfancy indexで書き換える方針にしてみると良いと思います。
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条件に沿ってインデックスを取って処理するような部分が多いので、そういうところはnumpyのboolean maskやfancy indexなどで書き換える方針にしてみると良いと思います。
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