回答編集履歴
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追記
test
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> また一方で、サーバーにログインして、GitでソースをPullしたのち、
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> サーバー上でコンパイル、デプロイすることは出来ないのでしょうか?
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これでもいいです。
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GradleやMaven(完全にイコールではないですがRuby・PHPでいうところのBundlerやComposerのようなもの)を導入しているなら簡単にできるでしょう。
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一方、レガシーな現場ではGradle/Mavenを使わず、Eclipseの設定でゴリゴリビルド設定を作り込んでいるような場合があり、その場合はサーバ上で同じ環境を用意するのがかなり面倒なので、実質ローカルでビルドしてからjar/warを上げる方法しか採れないと思います(なのでプロジェクト初期からGradle/Mavenを導入しておきましょう)。
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私なら、JavaだろうがRubyだろうがPHPだろうが、先の回答者さんが言うように、Jenkinsか、CircleCI等のCIサービスを使って自動ビルド+デプロイ環境を構築します。
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