回答編集履歴
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sudo について
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Permission denied とあるので、ファイルの権限上の問題に思われます。
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おそらく `~/.rbenv`の所有者をログインユーザにして、書き込み権限をつければ問題ないと思います。
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rbenvはログインユーザの権限でgemをインストールしますが、Rubyを普通にインストールする場合、root権限が必要になります。
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rbenv上のgemをインストールする途中で`sudo`してインストールしてしまい、`.rbenv`以下にroot所有のファイルができてしまった、というのはわりとよくある事例なので、それではないかと思います。
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面倒だったら、バックアップをとって rbenv ごと再インストールするのがよいのではないでしょうか。
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`~/.rbenv`を`~/.rbenv_old` などにリネームして再インストールすれば元に戻すのも簡単ですし。
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