回答編集履歴
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修正
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質問の事象では、インデックス追加時に統計情報は更新されているはずですので、SQLを実行した後に改善されたということなら、[キャッシュ](https://technet.microsoft.com/ja-jp/library/cc748700.aspx#XSLTsection131121120120)の効果によるものではないかと考えられます。
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もし、性能が安定しないようなら、クエリプランが遅いものに変わっている可能性もあります。
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その際には早いクエリの実行計画を元に、[クエリヒント](https://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/ms181714(v=SQL.90).aspx)で実行計画が
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その際には早いクエリの実行計画を元に、[クエリヒント](https://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/ms181714(v=SQL.90).aspx)で実行計画が早いプランを選択されるようにすると良いかと。
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追記
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SQLを実行した結果によって、統計情報が更新されることはありません。
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SQL実行時には[クエリ オプティマイザ](https://technet.microsoft.com/ja-jp/library/cc748699.aspx)が統計情報を元にクエリプランを組み立てます。
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質問の事象では、インデックス追加時に統計情報は更新されているはずですので、SQLを実行した後に改善されたということなら、[キャッシュ](https://technet.microsoft.com/ja-jp/library/cc748700.aspx#XSLTsection131121120120)の効果によるものではないかと考えられます。
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質問の事象では、インデックス追加時に統計情報は更新されているはずですので、SQLを実行した後に改善されたということなら、[キャッシュ](https://technet.microsoft.com/ja-jp/library/cc748700.aspx#XSLTsection131121120120)の効果によるものではないかと考えられます。
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もし、性能が安定しないようなら、クエリプランが遅いものに変わっている可能性もあります。
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その際には早いクエリの実行計画を元に、[クエリヒント](https://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/ms181714(v=SQL.90).aspx)で実行計画が変更されないようにすると良いかと。
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