回答編集履歴
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Excel部分が書きかけだったので追記
answer
CHANGED
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@@ -17,7 +17,7 @@
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上記の理由によりファイルサイズを減らすアイデアは少ない。
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メールで他人に渡す等、すぐに開く事を想定していないのならZip等で圧縮しよう。
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（Excelはそもそも）
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（ExcelはそもそもXMLで書かれたテキストデータをZip圧縮しているので、CSVと比較して軽くなる事が多い）
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使い勝手も考えるとSQLiteが最善。
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データを一度全てぶち込んでしまって、コマンドラインや[クライアントソフト](https://forest.watch.impress.co.jp/library/software/sqldbbrowser/)でアクセスすると良い。
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