回答編集履歴
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参考追記
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[Tomcat/エラー：jar not loaded. See Servlet Spec 2.3, section 9.7.2. Offending class | Tipi](http://tunes.sakura.ne.jp/tipi/?Tomcat%2F%A5%A8%A5%E9%A1%BC%A1%A7jar%20not%20loaded.%20See%20Servlet%20Spec%202.3%2C%20section%209.7.2.%20Offending%20class)
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**【参考】**
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以下のスクリプトは、テスト環境にpayara-embeddedを使用しているビルドツリーのgradleのライブラリ依存関係設定です。javaee-apiはコンパイル時のみで使用する設定になっています。
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```groovy
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dependencies {
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//プロダクト用（コンパイル、実行、配布）
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compile 'org.slf4j:slf4j-api:1.7.25'
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compile 'com.google.guava:guava:22.0'
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compile 'com.google.inject:guice:4.1.0'
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compile 'com.ancientprogramming.fixedformat4j:fixedformat4j:1.2.2'
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//プロダクト用（コンパイル）
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compileOnly 'javax:javaee-api:7.0'
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compileOnly 'org.projectlombok:lombok:1.16.16'
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//プロダクト用（実行、配布）
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runtime 'ch.qos.logback:logback-classic:1.2.3'
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//テスト用（コンパイル、実行）
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testCompile 'junit:junit:4.12'
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testCompile 'org.assertj:assertj-core:3.8.0'
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testCompile 'org.mockito:mockito-core:2.8.9'
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testCompile 'org.jboss.arquillian.junit:arquillian-junit-container:1.1.13.Final'
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testCompile 'org.jboss.arquillian.container:arquillian-glassfish-embedded-3.1:1.0.0.Final'
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//テスト用（コンパイル）
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testCompileOnly 'javax:javaee-api:7.0'
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//テスト用（実行）
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testRuntime 'fish.payara.api:payara-api:4.1.2.172'
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testRuntime 'fish.payara.extras:payara-embedded-all:4.1.2.172'
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}
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servlet-api.jarはコンパイル時にするだけでwarファイルには含めないものです。
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実行時にはtomcatなどのAPサーバのライブラリを使用するようになっています。
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servlet-api.jarはコンパイル時にするだけでwarファイルには含めないものです。
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[Tomcat/エラー：jar not loaded. See Servlet Spec 2.3, section 9.7.2. Offending class | Tipi](http://tunes.sakura.ne.jp/tipi/?Tomcat%2F%A5%A8%A5%E9%A1%BC%A1%A7jar%20not%20loaded.%20See%20Servlet%20Spec%202.3%2C%20section%209.7.2.%20Offending%20class)
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