回答編集履歴
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追加情報が来たので更新
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同じPythonを使用していれば、結果は同じになるはずです。異なっている場合は、使用するPythonのバージョンが統一されていないので、同じPythonを使うようにしてみてください
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結果が同じという回答をもらったので、更新します。
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* 確認2: `python -c "import bs4"` を実行してエラーにならないか？
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* 確認3: `pip3 uninstall beautifulsoup4 -y` を実行してアンインストールしてから、再度 `pip3 install beautifulsoup4` を実行し、確認2を実行するとどうなるか
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`from bs4 import BeautifulSoup` と書いてあれば動作すると思います。
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`ImportError: No module named 'bs4'` と表示されるということなので、実行しているPythonと、インストールに使用したPythonが異なっているのが原因だと思われます。
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`pip3 install beautifulsoup4` でインストールしたということですが、この `pip3` のpythonはプログラムを実行するために使っているPythonと同じでしょうか？以下を確認してみてください
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（上記の `python` の部分はあなたがプログラムを実行するときに使っているPython (python2 とかpython3とかpython3.5とか）に置き換えて実行してください）
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同じPythonを使用していれば、結果は同じになるはずです。異なっている場合は、使用するPythonのバージョンが統一されていないので、同じPythonを使うようにしてみてください
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