質問編集履歴
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File without changes
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@@ -56,239 +56,7 @@
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58
58
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59
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-
def detect_peak():
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60
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-
global x
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62
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-
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63
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-
global y
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65
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-
#signal.find_peaks(x, height=高さ, distance=距離)
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68
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-
# 極大値 orderを変えることでピークの検出が変わる(ピーク検出の閾値)
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70
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-
maxid = signal.argrelmax(y, order=100)
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-
# minid = signal.argrelmin(y, order=1) #極小値
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-
# plt.plot(x[minid],y[minid],'bo',label='ピーク値（最小）')
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83
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return x[maxid], y[maxid]
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def func(x, *params):
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-
#paramsの長さでフィッティングする関数の数を判別。
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num_func = int(len(params)/3)
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#ガウス関数にそれぞれのパラメータを挿入してy_listに追加。
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100
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101
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-
y_list = []
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102
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103
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-
for i in range(num_func):
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-
y = np.zeros_like(x)
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106
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-
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-
param_range = list(range(3*i,3*(i+1),1))
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108
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-
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-
amp = params[int(param_range[0])]
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110
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-
ctr = params[int(param_range[1])]
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-
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-
wid = params[int(param_range[2])]
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-
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115
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-
y = y + amp * np.exp( -((x - ctr)/wid)**2)
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-
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-
y_list.append(y)
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-
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120
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-
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-
#y_listに入っているすべてのガウス関数を重ね合わせる。
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122
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-
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-
y_sum = np.zeros_like(x)
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124
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-
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-
for i in y_list:
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126
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-
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127
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-
y_sum = y_sum + i
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-
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129
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-
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130
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-
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131
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-
#最後にバックグラウンドを追加。
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-
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133
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-
y_sum = y_sum + params[-1]
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-
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135
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-
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136
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-
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137
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-
return y_sum
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138
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-
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139
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-
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140
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-
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141
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-
#プロットの定義
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143
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-
def fit_plot(x, *params):
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144
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-
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145
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-
num_func = int(len(params)/3)
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146
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-
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147
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-
y_list = []
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148
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-
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149
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-
for i in range(num_func):
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150
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-
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151
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-
y = np.zeros_like(x)
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152
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-
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153
|
-
param_range = list(range(3*i,3*(i+1),1))
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154
|
-
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155
|
-
amp = params[int(param_range[0])]
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156
|
-
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157
|
-
ctr = params[int(param_range[1])]
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158
|
-
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159
|
-
wid = params[int(param_range[2])]
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160
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-
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161
|
-
y = y + amp * np.exp( -((x - ctr)/wid)**2) + params[-1]
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162
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-
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163
|
-
y_list.append(y)
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164
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-
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165
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-
return y_list
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166
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-
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167
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-
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168
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-
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169
|
-
#初期値のリストを作成
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170
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-
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171
|
-
#[amp,ctr,wid]
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172
|
-
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173
|
-
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174
|
-
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175
|
-
# x1, y1 = detect_peak() ##
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176
|
-
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177
|
-
np_x, np_y = detect_peak() ##
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178
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-
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179
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-
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180
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-
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181
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-
background = 62
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182
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-
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183
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-
# guess = [] ##
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184
|
-
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185
|
-
guess = [[y1, x1, 0.5] for (x1, y1) in zip(np_x, np_y) if background < y1]
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186
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-
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187
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-
#バックグラウンドの初期値
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188
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-
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189
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-
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190
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-
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191
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-
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192
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-
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193
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-
#初期値リストの結合
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194
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-
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195
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-
guess_total = []
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196
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-
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197
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-
for i in guess:
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198
|
-
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199
|
-
guess_total.extend(i)
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200
|
-
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201
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-
guess_total.append(background)
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202
|
-
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203
|
-
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204
|
-
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205
|
-
popt, pcov = curve_fit(func, x, y, p0=guess_total,maxfev=100000)
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206
|
-
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207
|
-
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208
|
-
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209
|
-
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210
|
-
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211
|
-
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212
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-
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213
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-
fit= func(x, *popt)
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214
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-
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215
|
-
plt.scatter(x, y, s=20)
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216
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-
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217
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-
plt.plot(x, fit , ls='-', c='black', lw=1)
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218
|
-
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219
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-
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220
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-
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221
|
-
y_list = fit_plot(x, *popt)
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222
|
-
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223
|
-
baseline = np.zeros_like(x) + popt[-1]
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224
|
-
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225
|
-
for n,i in enumerate(y_list):
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226
|
-
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227
|
-
plt.fill_between(x, i, baseline, facecolor=cm.rainbow(n/len(y_list)), alpha=0.6)
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228
|
-
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229
|
-
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|
230
|
-
|
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231
|
-
sub_list=list((popt))
|
|
232
|
-
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|
233
|
-
|
|
234
|
-
|
|
235
|
-
l_list=sub_list[1:-1:3]
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236
|
-
|
|
237
|
-
r=np.array(l_list)
|
|
238
|
-
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|
239
|
-
rad=np.radians(r)
|
|
240
|
-
|
|
241
|
-
sin=np.sin(rad/2)
|
|
242
|
-
|
|
243
|
-
|
|
244
|
-
|
|
245
|
-
Cuk_Alpha=1.5418
|
|
246
|
-
|
|
247
|
-
last_list=Cuk_Alpha/(2*sin)
|
|
248
|
-
|
|
249
|
-
|
|
250
|
-
|
|
251
|
-
|
|
252
|
-
|
|
253
|
-
P_list=sub_list[0:-1]
|
|
254
|
-
|
|
255
|
-
|
|
256
|
-
|
|
257
|
-
n1=3
|
|
258
|
-
|
|
259
|
-
result1 = [P_list[idx:idx + n1] for idx in range(0,len(P_list),n1)]
|
|
260
|
-
|
|
261
|
-
pd.set_option('display.unicode.east_asian_width',True)
|
|
262
|
-
|
|
263
|
-
df1=pd.DataFrame(result1,columns=['ピーク強度','位置','幅'])
|
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264
|
-
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|
265
|
-
|
|
266
|
-
|
|
267
|
-
|
|
268
|
-
|
|
269
|
-
n2=1
|
|
270
|
-
|
|
271
|
-
result2 = [last_list[idx:idx + n2] for idx in range(0,len(last_list),n2)]
|
|
272
|
-
|
|
273
|
-
pd.set_option('display.unicode.east_asian_width',True)
|
|
274
|
-
|
|
275
|
-
df2=pd.DataFrame(result2,columns=['面間隔'])
|
|
276
|
-
|
|
277
|
-
|
|
278
|
-
|
|
279
|
-
df_h_in = pd.concat([df1, df2], axis=1, join='inner')
|
|
280
|
-
|
|
281
|
-
print(df_h_in)
|
|
282
|
-
|
|
283
|
-
|
|
284
|
-
|
|
285
|
-
print('バックグラウンドの強度',sub_list[-1])
|
|
286
|
-
|
|
287
|
-
|
|
288
|
-
|
|
289
|
-
csv_datafile=input("保存データ名")
|
|
290
|
-
|
|
291
|
-
df_h_in.to_csv(csv_datafile, sep=",",index=False)
|
|
292
60
|
|
|
293
61
|
```
|
|
294
62
|
|
|
@@ -301,31 +69,3 @@
|
|
|
301
69
|
https://masaeng.hatenablog.com/entry/2020/06/28/233020
|
|
302
70
|
|
|
303
71
|
などのサイトも確認しましたがx,yの壁が立ちはだかりチンプンカンプンでした
|
|
304
|
-
|
|
305
|
-
|
|
306
|
-
|
|
307
|
-
### 変更追記
|
|
308
|
-
|
|
309
|
-
```Python
|
|
310
|
-
|
|
311
|
-
datafile=input("入力データ")
|
|
312
|
-
|
|
313
|
-
process(datafile)
|
|
314
|
-
|
|
315
|
-
def process():
|
|
316
|
-
|
|
317
|
-
def detect_peak():
|
|
318
|
-
|
|
319
|
-
x, y = np.loadtxt(datafile, skiprows=29, unpack=True)
|
|
320
|
-
|
|
321
|
-
|
|
322
|
-
|
|
323
|
-
#signal.find_peaks(x, height=高さ, distance=距離)
|
|
324
|
-
|
|
325
|
-
|
|
326
|
-
|
|
327
|
-
# 極大値 orderを変えることでピークの検出が変わる(ピーク検出の閾値)
|
|
328
|
-
|
|
329
|
-
maxid = signal.argrelmax(y, order=100)
|
|
330
|
-
|
|
331
|
-
```
|
3
訂正
test
CHANGED
|
File without changes
|
test
CHANGED
|
@@ -310,13 +310,13 @@
|
|
|
310
310
|
|
|
311
311
|
datafile=input("入力データ")
|
|
312
312
|
|
|
313
|
-
process(data
|
|
313
|
+
process(datafile)
|
|
314
314
|
|
|
315
315
|
def process():
|
|
316
316
|
|
|
317
317
|
def detect_peak():
|
|
318
318
|
|
|
319
|
-
x, y = np.loadtxt(data
|
|
319
|
+
x, y = np.loadtxt(datafile, skiprows=29, unpack=True)
|
|
320
320
|
|
|
321
321
|
|
|
322
322
|
|
2
追記
test
CHANGED
|
File without changes
|
test
CHANGED
|
@@ -301,3 +301,31 @@
|
|
|
301
301
|
https://masaeng.hatenablog.com/entry/2020/06/28/233020
|
|
302
302
|
|
|
303
303
|
などのサイトも確認しましたがx,yの壁が立ちはだかりチンプンカンプンでした
|
|
304
|
+
|
|
305
|
+
|
|
306
|
+
|
|
307
|
+
### 変更追記
|
|
308
|
+
|
|
309
|
+
```Python
|
|
310
|
+
|
|
311
|
+
datafile=input("入力データ")
|
|
312
|
+
|
|
313
|
+
process(data_file)
|
|
314
|
+
|
|
315
|
+
def process():
|
|
316
|
+
|
|
317
|
+
def detect_peak():
|
|
318
|
+
|
|
319
|
+
x, y = np.loadtxt(data_file, skiprows=29, unpack=True)
|
|
320
|
+
|
|
321
|
+
|
|
322
|
+
|
|
323
|
+
#signal.find_peaks(x, height=高さ, distance=距離)
|
|
324
|
+
|
|
325
|
+
|
|
326
|
+
|
|
327
|
+
# 極大値 orderを変えることでピークの検出が変わる(ピーク検出の閾値)
|
|
328
|
+
|
|
329
|
+
maxid = signal.argrelmax(y, order=100)
|
|
330
|
+
|
|
331
|
+
```
|
1
文法の修正
test
CHANGED
|
File without changes
|
test
CHANGED
|
@@ -1,6 +1,8 @@
|
|
|
1
1
|
### 前提・実現したいこと
|
|
2
2
|
|
|
3
|
-
Python使い始めて約一か月の初心者なので力を貸してください
|
|
3
|
+
Python使い始めて約一か月の初心者なので力を貸してください
|
|
4
|
+
|
|
5
|
+
|
|
4
6
|
|
|
5
7
|
txtファイル2th-scan_BLT1.txt～2th-scan_BLTn.txt(nは数)を下記コードで1つずつ処理をしたいです。
|
|
6
8
|
|
|
@@ -8,7 +10,9 @@
|
|
|
8
10
|
|
|
9
11
|
複数のファイルを与えられたとき一つ一つ入力が大変なので自動処理できるよう変更すべき点を教えて頂きたいです。
|
|
10
12
|
|
|
11
|
-
色々調べたのですがtxtだったりskiprowsだったりx,yで必要な値を抜き出しているようなものがなかったので
|
|
13
|
+
色々調べたのですがtxtだったりskiprowsだったりx,yで必要な値を抜き出しているようなものがなかったので、、
|
|
14
|
+
|
|
15
|
+
|
|
12
16
|
|
|
13
17
|
コードを記載していただけると助かります、、
|
|
14
18
|
|
|
@@ -296,4 +300,4 @@
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https://masaeng.hatenablog.com/entry/2020/06/28/233020
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などのサイトも確認しましたがx,yの壁が立ちはだかりチンプンカンプンでした
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などのサイトも確認しましたがx,yの壁が立ちはだかりチンプンカンプンでした
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