質問編集履歴
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解決済み
test
CHANGED
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解決済みの質問です。
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test
CHANGED
@@ -1,245 +1,7 @@
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cにて、MPIを使用して並列計算を行い、二次元配列の受け渡すコードを実装したいと考えております。
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以下のようなサンプルコードを作成したのですが、このままでは
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確保していないメモリにアクセスしてしまいエラーを起こしてしまします。
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恐らく/* localの行数決定 */の箇所のelse部分で、
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一番最後のプロセスのtoの決定がうまく処理できていないことが原因なのではないかと考えております。
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以下がソースコードになります。
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mpi_sample.c
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解決済み
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#include <stdio.h>
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#include <stdlib.h>
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//mpi path
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#include "/usr/local/openmpi-4.1.1/include/mpi.h" /*if use local computer */
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//#include "mpi.h" /*if use super_computer*/
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void main(int argc, char **argv){
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int i, j, k;
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int l = 10;//global配列の長さ
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int row, from, to;
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double **ary_global, **ary_local;
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/* MPI Parameters */
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int myID, numProcs;
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MPI_Status mpi_status;
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/* MPI初期化 */
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MPI_Init(&argc, &argv);
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MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &myID);//プロセス番号
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MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &numProcs);//プロセスのサイズ
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/* localの行数決定 */
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row = l / numProcs + 1;//from,toの幅
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from = row*myID;
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if(myID < numProcs - 1){
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to = row*(myID + 1) - 1;
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}else{//一番最後のPID
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to = l;
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}
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/* ary_local,grobal確保 */
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ary_local = (double **)malloc(sizeof(double *) * row);
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for(i = 0; i < row; i++) ary_local[i] = (double *)malloc(sizeof(double) * l);
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ary_global = (double **)malloc(sizeof(double *) * (row * numProcs));
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for(i = 0; i < row * numProcs; i++) ary_global[i] = (double *)malloc(sizeof(double) * l);
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/*globalに初期値-1を代入 */
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for(i = 0; i < row*numProcs; i++){
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-
for(j = 0; j < l; j++){
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-
ary_global[i][j] = -1;
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-
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-
}
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-
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-
}
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-
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-
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-
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-
/* ary_localに値代入 */
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-
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-
for(i = from; i < to; i++){
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-
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-
for(j = 0; j < l; j ++){
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-
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-
if(i == j){
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-
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-
ary_local[i][j] = -1;
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-
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}else{
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ary_local[i][j] = i*j;
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-
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123
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-
}
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-
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125
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-
}
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-
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-
}
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-
/* localからglobalへ渡す */
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MPI_Gather(& ary_local[0][0], row * l, MPI_DOUBLE,
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-
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& ary_global[0][0], row * l, MPI_DOUBLE, 0, MPI_COMM_WORLD);
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-
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-
/* globalの内容表示 */
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if(myID == 0){
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-
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-
for(i = 0; i < row * numProcs; i ++){
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-
for(j = 0; j < l; j ++){
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-
printf("%lf, ",ary_global[i][j]);
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-
}
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printf("\n");
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}
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-
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-
}
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-
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-
/* ary_local,grobal free() */
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-
for(i = 0; i < row; i++) free(ary_local[i]);
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free(ary_local);
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-
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-
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-
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167
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-
for(i = 0; i < row * numProcs; i++) free(ary_global[i]);
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-
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-
free(ary_global);
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-
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-
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-
MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
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-
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-
MPI_Finalize();
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-
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-
}
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-
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179
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-
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180
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-
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181
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-
```
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182
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-
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183
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-
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184
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-
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185
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-
以下がプロセス数2で実行した際の結果です。
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186
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-
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187
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-
```terminal
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188
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-
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189
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-
$ mpicc -I/usr/local/openmpi-4.1.1/include -c mpi_sample.c
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190
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-
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191
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-
$ mpicc -I/usr/local/openmpi-4.1.1/include -g mpi_sample.o -o mpi_sample
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192
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-
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193
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-
$ mpirun -np 2 ./mpi_sample
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194
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-
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195
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-
*** Process received signal ***
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196
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-
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197
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-
Signal: Segmentation fault (11)
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198
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-
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199
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-
Signal code: Address not mapped (1)
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200
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-
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201
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-
Failing at address: (nil)
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202
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-
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203
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-
[ 0] /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(+0x41100)[0x7f0ff7618100]
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204
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-
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205
|
-
[ 1] ./mpi(+0x1401)[0x560c4a75d401]
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206
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-
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207
|
-
[ 2] /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(__libc_start_main+0xeb)[0x7f0ff75fb09b]
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208
|
-
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209
|
-
[ 3] ./mpi(+0x111a)[0x560c4a75d11a]
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210
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-
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211
|
-
*** End of error message ***
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212
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-
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213
|
-
--------------------------------------------------------------------------
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214
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-
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215
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-
Primary job terminated normally, but 1 process returned
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216
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-
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217
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-
a non-zero exit code. Per user-direction, the job has been aborted.
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218
|
-
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219
|
-
--------------------------------------------------------------------------
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220
|
-
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221
|
-
--------------------------------------------------------------------------
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222
|
-
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223
|
-
mpirun noticed that process rank 1 with PID 0 on node zenbook14 exited on signal 11 (Segmentation fault).
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224
|
-
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225
|
-
--------------------------------------------------------------------------
|
226
|
-
|
227
|
-
```
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228
2
|
|
229
3
|
|
230
4
|
|
231
5
|
|
232
6
|
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233
|
-
実装したいことは、
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234
|
-
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235
|
-
ary_local[row][l]で計算した結果を,ary_global[row * numProcs][l]にまとめるということです。
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236
|
-
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237
|
-
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238
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-
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239
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-
MPIに疎いため、原因と考えている事とは別の原因があるのかもしれませんが、
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240
|
-
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241
|
-
自
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7
|
+
自己解決したので削除しました、ありがとうございました。
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242
|
-
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243
|
-
|
244
|
-
|
245
|
-
申し訳ございませんが、改善案や別の良い実装方法があればお伺いしたいです。よろしくおねがいします。
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1
誤字
test
CHANGED
@@ -1 +1 @@
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1
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-
c MPI_Gatherを使用した二次元配列の受け渡しに関する質問
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1
|
+
c言語 MPI_Gatherを使用した二次元配列の受け渡しに関する質問
|
test
CHANGED
@@ -1,4 +1,4 @@
|
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1
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-
cにて、MPIを使用して並列計算を行
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1
|
+
cにて、MPIを使用して並列計算を行い、二次元配列の受け渡すコードを実装したいと考えております。
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2
2
|
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3
3
|
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4
4
|
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@@ -12,7 +12,7 @@
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12
12
|
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13
13
|
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14
14
|
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15
|
-
|
15
|
+
以下がソースコードになります。
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16
16
|
|
17
17
|
mpi_sample.c
|
18
18
|
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@@ -182,6 +182,8 @@
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182
182
|
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183
183
|
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184
184
|
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185
|
+
以下がプロセス数2で実行した際の結果です。
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186
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+
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185
187
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```terminal
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186
188
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187
189
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$ mpicc -I/usr/local/openmpi-4.1.1/include -c mpi_sample.c
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