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回答に対するレスポンス
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というエラーが出てpipコマンドが使用できなくなってしまいました．
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再びpipをpythonごと再インストールし，``--user``オプションでmarkdownをインストールするしか無いのでしょうか？
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##2016/04/20追記
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指示されたコマンドを実行した結果，以下のようになりました．
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``` bash
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% ls -la /usr/local/lib/python2.7/ | grep -i site-
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drwxr-xr-x 19 mk_mkee admin 646 Apr 14 21:24 site-packages
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```
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特に``/usr/local/lib/python2.7/``以下の権限は触っておらず，ログインユーザにも権限があると思うのですが，
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この状態でpip installを実行しても，Permissionエラーとなります．．．
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``` bash
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% pip install markdown
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OSError: [Errno 13] Permission denied: '/lib/python2.7/site-packages/markdown'
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回答の内容に対して追記しました．
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@@ -203,3 +203,109 @@
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InstallationError: Command /usr/local/opt/python/bin/python2.7 -c "import setuptools, tokenize;__file__='/private/var/folders/kw/s2s66jl17l7634cyv1r17spm0000gn/T/pip_build_mk_mkee/markdown/setup.py';exec(compile(getattr(tokenize, 'open', open)(__file__).read().replace('\r\n', '\n'), __file__, 'exec'))" install --record /var/folders/kw/s2s66jl17l7634cyv1r17spm0000gn/T/pip-v_8a_Y-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile failed with error code 1 in /private/var/folders/kw/s2s66jl17l7634cyv1r17spm0000gn/T/pip_build_mk_mkee/markdown
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##2016/04/14追記内容
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pipのアップデートを試したところ，エラーが発生したため，
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brewでpythonを再インストールしました．
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その結果，
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- python: ver2.7.11
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- pip: ver8.0.2
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がインストールされました．
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ですが，再インストール後も
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pipのアップデートやmarkdownパッケージのインストールでPermissionのエラーが出てしまいます．
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% pip install --upgrade pip
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IOError: [Errno 13] Permission denied: '/lib/python2.7/site-packages/pip/__init__.py'
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% pip install markdown
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IOError: [Errno 13] Permission denied: '/lib/python2.7/site-packages/markdown/__init__.py'
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試しに，
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sudo pip install --upgrade pip
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を実行したところ，インストールは完了しましたが，pipコマンドを実行するたびに
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Traceback (most recent call last):
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File "/usr/local/bin/pip", line 5, in <module>
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from pkg_resources import load_entry_point
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File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 3130, in <module>
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@_call_aside
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File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 3116, in _call_aside
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f(*args, **kwargs)
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File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 3143, in _initialize_master_working_set
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working_set = WorkingSet._build_master()
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File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 642, in _build_master
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ws.require(__requires__)
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File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 943, in require
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needed = self.resolve(parse_requirements(requirements))
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File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 830, in resolve
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raise DistributionNotFound(req, requirers)
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pkg_resources.DistributionNotFound: The 'pip==8.0.2' distribution was not found and is required by the application
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というエラーが出てpipコマンドが使用できなくなってしまいました．
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再びpipをpythonごと再インストールし，``--user``オプションでmarkdownをインストールするしか無いのでしょうか？
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