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ご確認ありがとうございます。はい、10カラム目だけのデータを調べますので、input ファイルの記述を修正いたしました。

2020/06/07 14:26

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kakuko
kakuko

スコア2

test CHANGED
File without changes
test CHANGED
@@ -14,27 +14,19 @@
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- TEST_00004 580327.Tthe_2548 2.1e-07 60.5 bactNOG[38] 06F4M@bactNOG,0EY64@cloNOG,0NSV1@firmNOG,0Y6CY@NOG
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+ TEST_00004 [10カラム目]06F4M@bactNOG,0EY64@cloNOG,0NSV1@firmNOG,0Y6CY@NOG
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+
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+ TEST_00005 [10カラム目]05CDF@bactNOG,0EP54@cloNOG,0ND91@firmNOG,COG0766@NOG
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+
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+ TEST_00006 [10カラム目]05C6Y@bactNOG,0D1MR@chloNOG,COG1004@NOG
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+
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+ TEST_00007 [10カラム目]05ESV@bactNOG,0EPU0@cloNOG,0NDX4@firmNOG,COG0472@NOG
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+
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+ TEST_00008 [10カラム目]00DGT@actNOG,08KGH@bactNOG,COG1316@NOG
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- TEST_00005 509191.AcelC_020100007381 3.4e-133 480.3 MURA GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0044424,GO:0044464 K00790 UAGCVT bactNOG[38] 05CDF@bactNOG,0EP54@cloNOG,0ND91@firmNOG,COG0766@NOG
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-
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-
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-
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- TEST_00006 926569.ANT_27250 4.4e-128 463.4 UGD GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003979,GO:0005975,GO:0005976,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0016051,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0043170,GO:0044238,GO:0044710,GO:0044723,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901576 K00012 UDPGD bactNOG[38] 05C6Y@bactNOG,0D1MR@chloNOG,COG1004@NOG
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-
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-
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-
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- TEST_00007 697303.Thewi_0160 8.9e-64 249.6 TAGO GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016780,GO:0030145,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0071944 K02851 bactNOG[38] 05ESV@bactNOG,0EPU0@cloNOG,0NDX4@firmNOG,COG0472@NOG
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-
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-
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- TEST_00008 471855.Shel_01960 2.8e-37 161.8 LYTR2 bactNOG[38] 00DGT@actNOG,08KGH@bactNOG,COG1316@NOG NA|NA|NA
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- ↓ sed処理により、「COG???」(?は数字)のキーワードを持つデータIDとそのキーワード「だけ」を抽出したい。
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+ 10カラム目に着目し、sed処理により、「COG???」(?は数字)のキーワードを持つデータIDとそのキーワード「だけ」を抽出したい。
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