質問編集履歴
1
データの全体像について補足しました
test
CHANGED
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File without changes
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test
CHANGED
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@@ -4,33 +4,67 @@
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4
4
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5
5
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<gene_name.txt>
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6
6
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7
|
-
ens_gene
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7
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+
ens_gene ext_gene
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8
8
|
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9
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-
1
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9
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+
1 ENSG00000210049 MT-TF
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10
10
|
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11
|
-
2
|
|
11
|
+
2 ENSG00000211459 MT-RNR1
|
|
12
12
|
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|
13
|
-
3
|
|
13
|
+
3 ENSG00000210077 MT-TV
|
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14
14
|
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15
|
-
4
|
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15
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+
4 ENSG00000210082 MT-RNR2
|
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16
|
+
|
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17
|
+
5 ENSG00000209082 MT-TL1
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18
|
+
|
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19
|
+
... ... ...
|
|
20
|
+
|
|
21
|
+
67136 ENSG00000284921 AC004852.4
|
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22
|
+
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23
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+
67137 ENSG00000285440 AC004852.6
|
|
24
|
+
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25
|
+
67138 ENSG00000285110 AC004852.5
|
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26
|
+
|
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27
|
+
67139 ENSG00000285363 MTRF1LP2
|
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28
|
+
|
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29
|
+
67140 ENSG00000285114 GSDMC
|
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16
30
|
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|
17
31
|
|
|
32
|
+
|
|
33
|
+
[67140 rows x 2 columns]
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18
34
|
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19
35
|
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20
36
|
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21
37
|
<test_FPKM.txt>
|
|
22
38
|
|
|
23
|
-
|
|
39
|
+
0
|
|
24
40
|
|
|
25
|
-
0
|
|
41
|
+
0 ENSG00000242268.2
|
|
26
42
|
|
|
27
|
-
1
|
|
43
|
+
1 ENSG00000270112.3
|
|
28
44
|
|
|
29
|
-
2
|
|
45
|
+
2 ENSG00000167578.15
|
|
30
46
|
|
|
31
|
-
3
|
|
47
|
+
3 ENSG00000273842.1
|
|
32
48
|
|
|
33
|
-
4
|
|
49
|
+
4 ENSG00000078237.5
|
|
50
|
+
|
|
51
|
+
... ...
|
|
52
|
+
|
|
53
|
+
60478 ENSG00000105063.17
|
|
54
|
+
|
|
55
|
+
60479 ENSG00000231119.2
|
|
56
|
+
|
|
57
|
+
60480 ENSG00000280861.1
|
|
58
|
+
|
|
59
|
+
60481 ENSG00000123685.7
|
|
60
|
+
|
|
61
|
+
60482 ENSG00000181518.3
|
|
62
|
+
|
|
63
|
+
|
|
64
|
+
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65
|
+
[60483 rows x 1 columns]
|
|
66
|
+
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|
67
|
+
|
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34
68
|
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35
69
|
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36
70
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@@ -86,6 +120,12 @@
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86
120
|
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87
121
|
```
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88
122
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123
|
+
２つのファイルは行数が異なります。
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124
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+
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125
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+
また、<test_FPKM.txt>に含まれる文字列は、<gene_name.txt>のens_gene列に小数点以下の数字が付与されています。
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126
|
+
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127
|
+
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128
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+
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89
129
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90
130
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91
131
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ただ、全本のファイルはそれぞれ65,000行くらいあり、全体のデータで処理すると動きません。
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