質問編集履歴
15
追記
test
CHANGED
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File without changes
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test
CHANGED
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@@ -80,7 +80,7 @@
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80
80
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81
81
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```
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82
82
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83
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-
###追記(1),(2),(3),(3.1)あります
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83
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+
###追記(1),(2),(3),(3.1),(4)あります
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84
84
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85
85
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86
86
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14
追記
test
CHANGED
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File without changes
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test
CHANGED
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@@ -257,3 +257,19 @@
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257
257
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すると、PILのと同じ値に変換できた。
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258
258
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259
259
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どうやら定数が掛けているよう。
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260
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+
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+
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262
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+
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263
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+
###追記(4)2018/10/19
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264
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+
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265
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+
そもそもtifファイルがtifに準拠したフォーマットになっているか確認する。
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266
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+
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267
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+
tifをバイナリエディタで開き中にあるタグの情報を確認する。
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268
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+
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269
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+
その後フリーのtif解析ソフトを使って確認してみる。(自信なかったので...)
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270
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+
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271
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+
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272
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+
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273
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+
以下、その結果を貼ります。
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274
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+
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275
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+
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13
追記
test
CHANGED
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File without changes
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test
CHANGED
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@@ -80,7 +80,7 @@
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80
80
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81
81
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```
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82
82
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-
###追記(1),(2)あります
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83
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+
###追記(1),(2),(3),(3.1)あります
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84
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85
85
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86
86
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追記
test
CHANGED
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File without changes
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test
CHANGED
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@@ -2,217 +2,227 @@
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2
2
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3
3
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4
4
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5
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-
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5
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+
しかし、表示される画像は同じなのに、
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6
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+
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6
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-
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7
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+
2つのデータが違う値で出てくるのです。
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8
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+
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9
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+
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10
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+
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11
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+
データを見るにPILの方が正しい。
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+
上がopencvを、下がPILを使ったコードになります。
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+
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+
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17
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+
お詳しい方いらっしゃいましたら、ご教授頂ければと思います。
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+
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+
```Python3
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20
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+
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21
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+
import cv2
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22
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+
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23
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+
import numpy as np
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24
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+
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25
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+
from matplotlib import pyplot as plt
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26
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+
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27
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+
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28
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+
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+
img = cv2.imread('data.tif',-1)
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30
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+
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31
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+
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32
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+
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33
|
+
plt.imshow(img)
|
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34
|
+
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35
|
+
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36
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+
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37
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+
#######データを確認##############
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38
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+
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39
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+
img[0][0]
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40
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+
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41
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+
#9.25e-43
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42
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+
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43
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+
```
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44
|
+
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45
|
+
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46
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+
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47
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+
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48
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+
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49
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+
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50
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+
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51
|
+
```python3
|
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52
|
+
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53
|
+
import matplotlib.pyplot as plt
|
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54
|
+
|
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55
|
+
import numpy as np
|
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56
|
+
|
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57
|
+
from PIL import Image
|
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58
|
+
|
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59
|
+
%matplotlib inline
|
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60
|
+
|
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61
|
+
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62
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+
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63
|
+
im = Image.open('data.tif')
|
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64
|
+
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65
|
+
#im.show()
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66
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+
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67
|
+
imarr = np.array(im)
|
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68
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+
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69
|
+
|
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70
|
+
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71
|
+
plt.imshow(imarr)
|
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72
|
+
|
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73
|
+
|
|
74
|
+
|
|
75
|
+
#######データを確認##############
|
|
76
|
+
|
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77
|
+
imarr[0][0]
|
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78
|
+
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79
|
+
#660
|
|
80
|
+
|
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81
|
+
```
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82
|
+
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83
|
+
###追記(1),(2)あります
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84
|
+
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85
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+
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86
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+
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87
|
+
###追記(1)
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88
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+
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89
|
+
Yhaya様のアドバイスを受けてopencvで読み込んでRGBに変換した後、描写することを試みました。
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90
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+
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91
|
+
調べて見ると
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92
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+
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93
|
+
`CV_img_RGB = CV_im[:, :, ::-1].copy()`
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94
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+
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95
|
+
を挿入し、RGBにするとのことでしたが、エラーが出てしましました。
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96
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+
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97
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+
どこかおかしなところがありますでしょうか。(追記(2)で一応対処済み)
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98
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+
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99
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+
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100
|
+
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101
|
+
```python3
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102
|
+
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103
|
+
%matplotlib inline
|
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104
|
+
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105
|
+
import cv2
|
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106
|
+
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107
|
+
from PIL import Image
|
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108
|
+
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109
|
+
import numpy as np
|
|
110
|
+
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111
|
+
from matplotlib import pyplot as plt
|
|
112
|
+
|
|
113
|
+
|
|
114
|
+
|
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115
|
+
CV_im =cv2.imread('data.tiff',-1)
|
|
116
|
+
|
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117
|
+
|
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118
|
+
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119
|
+
#BGRからRGBへ変換
|
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120
|
+
|
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121
|
+
CV_img_RGB = CV_im[:, :, ::-1].copy()
|
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122
|
+
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123
|
+
|
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124
|
+
|
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125
|
+
#変換
|
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126
|
+
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127
|
+
CV2PIL_normalize=Image.fromarray(CV_im_RGB)
|
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128
|
+
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129
|
+
|
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130
|
+
|
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131
|
+
#描画
|
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132
|
+
|
|
133
|
+
plt.imshow(CV2PIL_normalize)
|
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134
|
+
|
|
135
|
+
```
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136
|
+
|
|
137
|
+
```error
|
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138
|
+
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139
|
+
IndexError Traceback (most recent call last)
|
|
140
|
+
|
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141
|
+
<ipython-input-108-5afa93a697bc> in <module>()
|
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142
|
+
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143
|
+
8
|
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144
|
+
|
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145
|
+
9 #BGRからRGBへ変換
|
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146
|
+
|
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147
|
+
---> 10 CV_img_RGB = CV_im[:, :, ::-1].copy()
|
|
148
|
+
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149
|
+
11
|
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150
|
+
|
|
151
|
+
12 #変換
|
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152
|
+
|
|
153
|
+
|
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154
|
+
|
|
155
|
+
IndexError: too many indices for array
|
|
156
|
+
|
|
157
|
+
```
|
|
158
|
+
|
|
159
|
+
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160
|
+
|
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161
|
+
###追記(2)2018/10/26
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162
|
+
|
|
163
|
+
|
|
164
|
+
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165
|
+
> ------追記(1)より
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166
|
+
|
|
167
|
+
`CV_img_RGB = CV_im[:, :, ::-1].copy()`
|
|
168
|
+
|
|
169
|
+
を挿入し、RGBにするとのことでしたが、エラーが出てしましました。
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|
170
|
+
|
|
171
|
+
|
|
172
|
+
|
|
173
|
+
これは
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|
174
|
+
|
|
175
|
+
`CV_img_RGB = CV_im[:, ::-1].copy()`
|
|
176
|
+
|
|
177
|
+
に変えることで、正常に動くようになりました。
|
|
178
|
+
|
|
179
|
+
`[:, :, ::-1]`この中の次元をCV_imと合わせる必要があったようです。
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180
|
+
|
|
181
|
+
|
|
182
|
+
|
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183
|
+
これによって表示された画像は、変換前から変化がありました。
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|
184
|
+
|
|
185
|
+
ただ、imarrの(PILで読み込んだ正しい)データと比べると
|
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186
|
+
|
|
187
|
+
CV_img_RGBの(openCVで読み込んでRGB変換した)データは違う。
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|
188
|
+
|
|
189
|
+
(しかも見当違いに違う、e-43も違うとは...)
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190
|
+
|
|
191
|
+
```Python3
|
|
192
|
+
|
|
193
|
+
print(imarr[0][0])
|
|
194
|
+
|
|
195
|
+
#660
|
|
196
|
+
|
|
197
|
+
|
|
198
|
+
|
|
199
|
+
print(CV_im_RGB[0][0])
|
|
200
|
+
|
|
201
|
+
#6.32e-43
|
|
202
|
+
|
|
203
|
+
```
|
|
204
|
+
|
|
205
|
+
|
|
206
|
+
|
|
7
|
-
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|
207
|
+
###追記(3)2018/10/26
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8
208
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9
209
|
取り扱うtifデータは1ピクセルにカウント数の入ったデータなのでグレースケール相当のものです。カウント数の範囲は、-2から177880です。
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10
210
|
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11
|
-
|
|
12
|
-
|
|
13
|
-
|
|
14
|
-
|
|
15
|
-
|
|
16
|
-
|
|
17
|
-
|
|
18
|
-
|
|
19
|
-
2
|
|
20
|
-
|
|
21
|
-
|
|
22
|
-
|
|
23
|
-
|
|
24
|
-
|
|
25
|
-
|
|
26
|
-
|
|
27
|
-
|
|
28
|
-
|
|
29
|
-
お詳しい方いらっしゃいましたら、ご教授頂ければと思います。
|
|
30
|
-
|
|
31
|
-
```Python3
|
|
32
|
-
|
|
33
|
-
import cv2
|
|
34
|
-
|
|
35
|
-
import numpy as np
|
|
36
|
-
|
|
37
|
-
from matplotlib import pyplot as plt
|
|
38
|
-
|
|
39
|
-
|
|
40
|
-
|
|
41
|
-
img = cv2.imread('data.tif',-1)
|
|
42
|
-
|
|
43
|
-
|
|
44
|
-
|
|
45
|
-
plt.imshow(img)
|
|
46
|
-
|
|
47
|
-
|
|
48
|
-
|
|
49
|
-
#######データを確認##############
|
|
50
|
-
|
|
51
|
-
img[0][0]
|
|
52
|
-
|
|
53
|
-
#9.25e-43
|
|
54
|
-
|
|
55
|
-
```
|
|
56
|
-
|
|
57
|
-
|
|
58
|
-
|
|
59
|
-
|
|
60
|
-
|
|
61
|
-
|
|
62
|
-
|
|
63
|
-
```python3
|
|
64
|
-
|
|
65
|
-
import matplotlib.pyplot as plt
|
|
66
|
-
|
|
67
|
-
import numpy as np
|
|
68
|
-
|
|
69
|
-
from PIL import Image
|
|
70
|
-
|
|
71
|
-
%matplotlib inline
|
|
72
|
-
|
|
73
|
-
|
|
74
|
-
|
|
75
|
-
im = Image.open('data.tif')
|
|
76
|
-
|
|
77
|
-
#im.show()
|
|
78
|
-
|
|
79
|
-
imarr = np.array(im)
|
|
80
|
-
|
|
81
|
-
|
|
82
|
-
|
|
83
|
-
plt.imshow(imarr)
|
|
84
|
-
|
|
85
|
-
|
|
86
|
-
|
|
87
|
-
#######データを確認##############
|
|
88
|
-
|
|
89
|
-
imarr[0][0]
|
|
90
|
-
|
|
91
|
-
#660
|
|
92
|
-
|
|
93
|
-
```
|
|
94
|
-
|
|
95
|
-
###追記(1),(2)あります
|
|
96
|
-
|
|
97
|
-
|
|
98
|
-
|
|
99
|
-
###追記(1)
|
|
100
|
-
|
|
101
|
-
Yhaya様のアドバイスを受けてopencvで読み込んでRGBに変換した後、描写することを試みました。
|
|
102
|
-
|
|
103
|
-
調べて見ると
|
|
104
|
-
|
|
105
|
-
`CV_img_RGB = CV_im[:, :, ::-1].copy()`
|
|
106
|
-
|
|
107
|
-
を挿入し、RGBにするとのことでしたが、エラーが出てしましました。
|
|
108
|
-
|
|
109
|
-
どこかおかしなところがありますでしょうか。(追記(2)で一応対処済み)
|
|
110
|
-
|
|
111
|
-
|
|
112
|
-
|
|
113
|
-
```python3
|
|
114
|
-
|
|
115
|
-
%matplotlib inline
|
|
116
|
-
|
|
117
|
-
import cv2
|
|
118
|
-
|
|
119
|
-
from PIL import Image
|
|
120
|
-
|
|
121
|
-
import numpy as np
|
|
122
|
-
|
|
123
|
-
from matplotlib import pyplot as plt
|
|
124
|
-
|
|
125
|
-
|
|
126
|
-
|
|
127
|
-
CV_im =cv2.imread('data.tiff',-1)
|
|
128
|
-
|
|
129
|
-
|
|
130
|
-
|
|
131
|
-
#BGRからRGBへ変換
|
|
132
|
-
|
|
133
|
-
CV_img_RGB = CV_im[:, :, ::-1].copy()
|
|
134
|
-
|
|
135
|
-
|
|
136
|
-
|
|
137
|
-
#変換
|
|
138
|
-
|
|
139
|
-
CV2PIL_normalize=Image.fromarray(CV_im_RGB)
|
|
140
|
-
|
|
141
|
-
|
|
142
|
-
|
|
143
|
-
#描画
|
|
144
|
-
|
|
145
|
-
plt.imshow(CV2PIL_normalize)
|
|
146
|
-
|
|
147
|
-
```
|
|
148
|
-
|
|
149
|
-
```error
|
|
150
|
-
|
|
151
|
-
IndexError Traceback (most recent call last)
|
|
152
|
-
|
|
153
|
-
<ipython-input-108-5afa93a697bc> in <module>()
|
|
154
|
-
|
|
155
|
-
8
|
|
156
|
-
|
|
157
|
-
9 #BGRからRGBへ変換
|
|
158
|
-
|
|
159
|
-
---> 10 CV_img_RGB = CV_im[:, :, ::-1].copy()
|
|
160
|
-
|
|
161
|
-
11
|
|
162
|
-
|
|
163
|
-
12 #変換
|
|
164
|
-
|
|
165
|
-
|
|
166
|
-
|
|
167
|
-
IndexError: too many indices for array
|
|
168
|
-
|
|
169
|
-
```
|
|
170
|
-
|
|
171
|
-
|
|
172
|
-
|
|
173
|
-
###追記(2)2018/10/26
|
|
174
|
-
|
|
175
|
-
|
|
176
|
-
|
|
177
|
-
> ------追記(1)より
|
|
178
|
-
|
|
179
|
-
`CV_img_RGB = CV_im[:, :, ::-1].copy()`
|
|
180
|
-
|
|
181
|
-
を挿入し、RGBにするとのことでしたが、エラーが出てしましました。
|
|
182
|
-
|
|
183
|
-
|
|
184
|
-
|
|
185
|
-
これは
|
|
186
|
-
|
|
187
|
-
`CV_img_RGB = CV_im[:, ::-1].copy()`
|
|
188
|
-
|
|
189
|
-
に変えることで、正常に動くようになりました。
|
|
190
|
-
|
|
191
|
-
`[:, :, ::-1]`この中の次元をCV_imと合わせる必要があったようです。
|
|
192
|
-
|
|
193
|
-
|
|
194
|
-
|
|
195
|
-
これによって表示された画像は、変換前から変化がありました。
|
|
196
|
-
|
|
197
|
-
ただ、imarrの(PILで読み込んだ正しい)データと比べると
|
|
198
|
-
|
|
199
|
-
CV_img_RGBの(openCVで読み込んでRGB変換した)データは違う。
|
|
200
|
-
|
|
201
|
-
(しかも見当違いに違う、e-43も違うとは...)
|
|
202
|
-
|
|
203
|
-
```Python3
|
|
204
|
-
|
|
205
|
-
print(imarr[0][0])
|
|
206
|
-
|
|
207
|
-
#660
|
|
208
|
-
|
|
209
|
-
|
|
210
|
-
|
|
211
|
-
print(CV_im_RGB[0][0])
|
|
212
|
-
|
|
213
|
-
#6.32e-43
|
|
214
|
-
|
|
215
|
-
```
|
|
211
|
+
ですので、opencvもPILも配列に変換した後は高さ×幅の2次元になります。
|
|
212
|
+
|
|
213
|
+
|
|
214
|
+
|
|
215
|
+
RGBのように3つあるわけではないので、opencvやPILを使うべきデータではないということなのでしょうか。そもそも一般的なtifファイルではない(グレースケールの場合0~255)ので取扱いも違うのでしょうか。
|
|
216
|
+
|
|
217
|
+
|
|
218
|
+
|
|
219
|
+
最終的に作りたいプログラムは、カウント数の範囲(-2から177880)のデータを画像として表示させる為に(グレースケールの場合)256に分割して表示したいということです。
|
|
220
|
+
|
|
221
|
+
その為、minmumとmaximumを調整するプログラムを作りたいと思いました。
|
|
222
|
+
|
|
223
|
+
|
|
224
|
+
|
|
225
|
+
minmumは最小値で固定して、maximumを200000にしたり100000にしたりと変更させ、それを256で区別して、表示させる。という感じです。
|
|
216
226
|
|
|
217
227
|
|
|
218
228
|
|
11
追記
test
CHANGED
|
File without changes
|
test
CHANGED
|
@@ -6,7 +6,7 @@
|
|
|
6
6
|
|
|
7
7
|
> ・追記(3)2018/10/26
|
|
8
8
|
|
|
9
|
-
取り扱うtifデータは1ピクセルにカウント数の入ったデータなのでグレースケール相当のものです。
|
|
9
|
+
取り扱うtifデータは1ピクセルにカウント数の入ったデータなのでグレースケール相当のものです。カウント数の範囲は、-2から177880です。
|
|
10
10
|
|
|
11
11
|
|
|
12
12
|
|
|
@@ -238,7 +238,7 @@
|
|
|
238
238
|
|
|
239
239
|
660(`imarr[0][0]`)/9.25e-43(`img[0][0]`)
|
|
240
240
|
|
|
241
|
-
を全
|
|
241
|
+
を全配列に掛けてみた。
|
|
242
242
|
|
|
243
243
|
`img * 660/9.25e-43`
|
|
244
244
|
|
10
追記
test
CHANGED
|
File without changes
|
test
CHANGED
|
@@ -216,6 +216,34 @@
|
|
|
216
216
|
|
|
217
217
|
|
|
218
218
|
|
|
219
|
+
###追記(3.1)2018/10/26
|
|
220
|
+
|
|
221
|
+
上の追記(3)でも書いたように元データのtifが1色(カウント数)相当だったため、
|
|
222
|
+
|
|
219
|
-
|
|
223
|
+
質問当初に書いたように読み込みを行った場合を考えた。
|
|
224
|
+
|
|
220
|
-
|
|
225
|
+
・PILの場合
|
|
226
|
+
|
|
227
|
+
`imarr[0][0]` = 660 あってる
|
|
228
|
+
|
|
229
|
+
|
|
230
|
+
|
|
231
|
+
・opencvの場合
|
|
232
|
+
|
|
233
|
+
`img[0][0]` = 9.25e-43 良くわからない
|
|
234
|
+
|
|
235
|
+
|
|
236
|
+
|
|
237
|
+
そこでopencvのデータに(img[0][0]のデータが660になる)
|
|
238
|
+
|
|
239
|
+
660(`imarr[0][0]`)/9.25e-43(`img[0][0]`)
|
|
240
|
+
|
|
241
|
+
を全部にかけてみた。
|
|
242
|
+
|
|
243
|
+
`img * 660/9.25e-43`
|
|
244
|
+
|
|
245
|
+
|
|
246
|
+
|
|
247
|
+
すると、PILのと同じ値に変換できた。
|
|
248
|
+
|
|
221
|
-
|
|
249
|
+
どうやら定数が掛けているよう。
|
9
追記
test
CHANGED
|
File without changes
|
test
CHANGED
|
@@ -2,6 +2,18 @@
|
|
|
2
2
|
|
|
3
3
|
|
|
4
4
|
|
|
5
|
+
|
|
6
|
+
|
|
7
|
+
> ・追記(3)2018/10/26
|
|
8
|
+
|
|
9
|
+
取り扱うtifデータは1ピクセルにカウント数の入ったデータなのでグレースケール相当のものです。
|
|
10
|
+
|
|
11
|
+
|
|
12
|
+
|
|
13
|
+
|
|
14
|
+
|
|
15
|
+
|
|
16
|
+
|
|
5
17
|
しかし、表示される画像は同じなのに、
|
|
6
18
|
|
|
7
19
|
2つのデータが違う値で出てくるのです。
|
8
追記
test
CHANGED
|
File without changes
|
test
CHANGED
|
@@ -186,7 +186,7 @@
|
|
|
186
186
|
|
|
187
187
|
CV_img_RGBの(openCVで読み込んでRGB変換した)データは違う。
|
|
188
188
|
|
|
189
|
-
(しかも見当違いに違う、e-43とは...)
|
|
189
|
+
(しかも見当違いに違う、e-43も違うとは...)
|
|
190
190
|
|
|
191
191
|
```Python3
|
|
192
192
|
|
7
追記
test
CHANGED
|
File without changes
|
test
CHANGED
|
@@ -94,7 +94,7 @@
|
|
|
94
94
|
|
|
95
95
|
を挿入し、RGBにするとのことでしたが、エラーが出てしましました。
|
|
96
96
|
|
|
97
|
-
どこかおかしなところがありますでしょうか。
|
|
97
|
+
どこかおかしなところがありますでしょうか。(追記(2)で一応対処済み)
|
|
98
98
|
|
|
99
99
|
|
|
100
100
|
|
6
追記
test
CHANGED
|
File without changes
|
test
CHANGED
|
@@ -178,14 +178,24 @@
|
|
|
178
178
|
|
|
179
179
|
`[:, :, ::-1]`この中の次元をCV_imと合わせる必要があったようです。
|
|
180
180
|
|
|
181
|
+
|
|
182
|
+
|
|
181
183
|
これによって表示された画像は、変換前から変化がありました。
|
|
182
184
|
|
|
183
|
-
imarrの(PILで読み込んだ)データと比べると
|
|
185
|
+
ただ、imarrの(PILで読み込んだ正しい)データと比べると
|
|
184
186
|
|
|
185
187
|
CV_img_RGBの(openCVで読み込んでRGB変換した)データは違う。
|
|
186
188
|
|
|
189
|
+
(しかも見当違いに違う、e-43とは...)
|
|
190
|
+
|
|
187
191
|
```Python3
|
|
188
192
|
|
|
193
|
+
print(imarr[0][0])
|
|
194
|
+
|
|
195
|
+
#660
|
|
196
|
+
|
|
197
|
+
|
|
198
|
+
|
|
189
199
|
print(CV_im_RGB[0][0])
|
|
190
200
|
|
|
191
201
|
#6.32e-43
|
|
@@ -196,4 +206,4 @@
|
|
|
196
206
|
|
|
197
207
|
どうやったら同じように扱えるのかわかりません。。。。
|
|
198
208
|
|
|
199
|
-
tif画像処理むずし
|
|
209
|
+
tif画像処理むずし...
|
5
追記
test
CHANGED
|
File without changes
|
test
CHANGED
|
@@ -80,11 +80,11 @@
|
|
|
80
80
|
|
|
81
81
|
```
|
|
82
82
|
|
|
83
|
+
###追記(1),(2)あります
|
|
83
84
|
|
|
84
85
|
|
|
85
86
|
|
|
86
|
-
|
|
87
|
-
###追記
|
|
87
|
+
###追記(1)
|
|
88
88
|
|
|
89
89
|
Yhaya様のアドバイスを受けてopencvで読み込んでRGBに変換した後、描写することを試みました。
|
|
90
90
|
|
|
@@ -155,3 +155,45 @@
|
|
|
155
155
|
IndexError: too many indices for array
|
|
156
156
|
|
|
157
157
|
```
|
|
158
|
+
|
|
159
|
+
|
|
160
|
+
|
|
161
|
+
###追記(2)2018/10/26
|
|
162
|
+
|
|
163
|
+
|
|
164
|
+
|
|
165
|
+
> ------追記(1)より
|
|
166
|
+
|
|
167
|
+
`CV_img_RGB = CV_im[:, :, ::-1].copy()`
|
|
168
|
+
|
|
169
|
+
を挿入し、RGBにするとのことでしたが、エラーが出てしましました。
|
|
170
|
+
|
|
171
|
+
|
|
172
|
+
|
|
173
|
+
これは
|
|
174
|
+
|
|
175
|
+
`CV_img_RGB = CV_im[:, ::-1].copy()`
|
|
176
|
+
|
|
177
|
+
に変えることで、正常に動くようになりました。
|
|
178
|
+
|
|
179
|
+
`[:, :, ::-1]`この中の次元をCV_imと合わせる必要があったようです。
|
|
180
|
+
|
|
181
|
+
これによって表示された画像は、変換前から変化がありました。
|
|
182
|
+
|
|
183
|
+
imarrの(PILで読み込んだ)データと比べると
|
|
184
|
+
|
|
185
|
+
CV_img_RGBの(openCVで読み込んでRGB変換した)データは違う。
|
|
186
|
+
|
|
187
|
+
```Python3
|
|
188
|
+
|
|
189
|
+
print(CV_im_RGB[0][0])
|
|
190
|
+
|
|
191
|
+
#6.32e-43
|
|
192
|
+
|
|
193
|
+
```
|
|
194
|
+
|
|
195
|
+
|
|
196
|
+
|
|
197
|
+
どうやったら同じように扱えるのかわかりません。。。。
|
|
198
|
+
|
|
199
|
+
tif画像処理むずし……
|
4
追記
test
CHANGED
|
File without changes
|
test
CHANGED
|
@@ -86,6 +86,16 @@
|
|
|
86
86
|
|
|
87
87
|
###追記
|
|
88
88
|
|
|
89
|
+
Yhaya様のアドバイスを受けてopencvで読み込んでRGBに変換した後、描写することを試みました。
|
|
90
|
+
|
|
91
|
+
調べて見ると
|
|
92
|
+
|
|
93
|
+
`CV_img_RGB = CV_im[:, :, ::-1].copy()`
|
|
94
|
+
|
|
95
|
+
を挿入し、RGBにするとのことでしたが、エラーが出てしましました。
|
|
96
|
+
|
|
97
|
+
どこかおかしなところがありますでしょうか。
|
|
98
|
+
|
|
89
99
|
|
|
90
100
|
|
|
91
101
|
```python3
|
|
@@ -123,3 +133,25 @@
|
|
|
123
133
|
plt.imshow(CV2PIL_normalize)
|
|
124
134
|
|
|
125
135
|
```
|
|
136
|
+
|
|
137
|
+
```error
|
|
138
|
+
|
|
139
|
+
IndexError Traceback (most recent call last)
|
|
140
|
+
|
|
141
|
+
<ipython-input-108-5afa93a697bc> in <module>()
|
|
142
|
+
|
|
143
|
+
8
|
|
144
|
+
|
|
145
|
+
9 #BGRからRGBへ変換
|
|
146
|
+
|
|
147
|
+
---> 10 CV_img_RGB = CV_im[:, :, ::-1].copy()
|
|
148
|
+
|
|
149
|
+
11
|
|
150
|
+
|
|
151
|
+
12 #変換
|
|
152
|
+
|
|
153
|
+
|
|
154
|
+
|
|
155
|
+
IndexError: too many indices for array
|
|
156
|
+
|
|
157
|
+
```
|
3
追記
test
CHANGED
|
File without changes
|
test
CHANGED
|
@@ -79,3 +79,47 @@
|
|
|
79
79
|
#660
|
|
80
80
|
|
|
81
81
|
```
|
|
82
|
+
|
|
83
|
+
|
|
84
|
+
|
|
85
|
+
|
|
86
|
+
|
|
87
|
+
###追記
|
|
88
|
+
|
|
89
|
+
|
|
90
|
+
|
|
91
|
+
```python3
|
|
92
|
+
|
|
93
|
+
%matplotlib inline
|
|
94
|
+
|
|
95
|
+
import cv2
|
|
96
|
+
|
|
97
|
+
from PIL import Image
|
|
98
|
+
|
|
99
|
+
import numpy as np
|
|
100
|
+
|
|
101
|
+
from matplotlib import pyplot as plt
|
|
102
|
+
|
|
103
|
+
|
|
104
|
+
|
|
105
|
+
CV_im =cv2.imread('data.tiff',-1)
|
|
106
|
+
|
|
107
|
+
|
|
108
|
+
|
|
109
|
+
#BGRからRGBへ変換
|
|
110
|
+
|
|
111
|
+
CV_img_RGB = CV_im[:, :, ::-1].copy()
|
|
112
|
+
|
|
113
|
+
|
|
114
|
+
|
|
115
|
+
#変換
|
|
116
|
+
|
|
117
|
+
CV2PIL_normalize=Image.fromarray(CV_im_RGB)
|
|
118
|
+
|
|
119
|
+
|
|
120
|
+
|
|
121
|
+
#描画
|
|
122
|
+
|
|
123
|
+
plt.imshow(CV2PIL_normalize)
|
|
124
|
+
|
|
125
|
+
```
|
2
コードの変更
test
CHANGED
|
File without changes
|
test
CHANGED
|
@@ -60,9 +60,7 @@
|
|
|
60
60
|
|
|
61
61
|
|
|
62
62
|
|
|
63
|
-
path = "C:/Users/Uchiyama/Desktop/02_uchi_NiO_STO_015/02_uchi_NiO_STO_00015.tif"
|
|
64
|
-
|
|
65
|
-
im = Image.open(
|
|
63
|
+
im = Image.open('data.tif')
|
|
66
64
|
|
|
67
65
|
#im.show()
|
|
68
66
|
|
1
追記
test
CHANGED
|
File without changes
|
test
CHANGED
|
@@ -32,7 +32,19 @@
|
|
|
32
32
|
|
|
33
33
|
plt.imshow(img)
|
|
34
34
|
|
|
35
|
+
|
|
36
|
+
|
|
37
|
+
#######データを確認##############
|
|
38
|
+
|
|
39
|
+
img[0][0]
|
|
40
|
+
|
|
41
|
+
#9.25e-43
|
|
42
|
+
|
|
35
43
|
```
|
|
44
|
+
|
|
45
|
+
|
|
46
|
+
|
|
47
|
+
|
|
36
48
|
|
|
37
49
|
|
|
38
50
|
|
|
@@ -60,4 +72,12 @@
|
|
|
60
72
|
|
|
61
73
|
plt.imshow(imarr)
|
|
62
74
|
|
|
75
|
+
|
|
76
|
+
|
|
77
|
+
#######データを確認##############
|
|
78
|
+
|
|
79
|
+
imarr[0][0]
|
|
80
|
+
|
|
81
|
+
#660
|
|
82
|
+
|
|
63
83
|
```
|