実現したいこと
ここに実現したいことを箇条書きで書いてください。
- Rで主成分分析をする際、biplotを使用したときに変数の数だけ固有ベクトルが表示されます。表示させる固有ベクトルを減らすにはどうすればよいでしょうか
前提
ここに質問の内容を詳しく書いてください。
(例)
800個ほどの変数のあるリストについて、Rを用いて主成分分析しています。
発生している問題・エラーメッセージ
エラーは出ませんが、完成図に800個以上のベクトルが表示され、毛玉のようになっています。長いもの3つほど残して、残りは非表示にしたいです
dt <- "ファイル名.txt"
data <- read.table(dt, header=TRUE, row.names=1, sep="\t", quote="")
data.pca <- prcomp(data)
names(data.pca)
data.pca2 <- data.pca$rotation[,1:2]
summary(data.pca)
head(data.pca2)
write.csv(data.pca2,"outtestzoku.csv",row.names=F)
summary(data.pca2)
biplot(data.pca)
R
試したこと
plotで、個別に条件を指定して座標上にプロットしましたが、これだと、どの変数が各次元に重要なのかが分かりません
補足情報(FW/ツールのバージョンなど)
ここにより詳細な情報を記載してください。
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