Rmarkdownで順番通りに表示されない

Question

Rmarkdownで以下のようにコードを書いたのですが、
本来であれば

「AAA」
画像
「BBB」

となるはずが

「AAA」
「BBB」
画像
「CCC」

となります。
＃ちなみに画像はこの1回だけしか出てきません。
＃それもおかしいと思うのですが、とりあえず今回はなぜ「AAA」の後に画像が出てこないのかを焦点とさせてください。

＃下記ソースコードは今回の投稿用に一部編集しております。そのため不要なパッケージも見えるかと思いますが、無視してください。

---
title: "aaa"
output: 
  html_document:
    #self_contained: no
---

\```{r setup, echo=FALSE, warning=FALSE, eval=TRUE, include=FALSE}

#必要なpackage読み込み
library(bit)
library(ff)
library(ffbase)
library(ggplot2)
library(tableplot)
library(tabplot)
library(dplyr)
library(magrittr)
library(pipeR)
library(igraph)
library(knitr)
library(readr)
library(stringr)
library(grid)
library(gridBase)
library(magick)


#作業ディレクトリ設定
opts_knit$set(root.dir="C:/Users/kmaa/Desktop")

\```

## R Markdown


\```{r , echo=FALSE}
#knitr::include_graphics(path = "./temp.png")
read_png <- image_read("./top_os02.jpg")
cat("AAA")
plot(read_png)

read_png <- image_read("./top_os02.jpg")
cat("BBB")
plot(read_png)

read_png <- image_read("./top_os02.jpg")
cat("CCC")
plot(read_png)

read_png <- image_read("./top_os02.jpg")
cat("DDD")
plot(read_png)

read_png <- image_read("./top_os02.jpg")
cat("EEE")
plot(read_png)

read_png <- image_read("./top_os02.jpg")
cat("FFF")
plot(read_png)

\``` 

以下、実行結果です。
![

以上です。皆様のお力をお借りできれば幸いです。

Answer 1

Rmarkdownの仕様に詳しいわけではない（というか、今日初めて使ってみた）のですが、試してみると確かにご指摘のようになります。
Rコードのところにplotを書いても、同期的に処理されるというわけではないようです。
質問にあるようなイメージのドキュメントを得たいのであれば、##R markdown直下に、markdown書法で必要事項を書いていくしかないのではないでしょうか。

以下のコードは私がちょっと試しに書いてみたものの抜粋です。カレントディレクトリのtest.jpgを読み込んでout.jpgとして出力、同様にあと二つjpgファイルを生成しつつ、それをインラインイメージとして利用するhtmlファイルを生成するものです。Rstudioで試したところでは一応うまくファイルが生成されました。
おやりになりたいこととマッチしているかどうかわかりませんが、参考として。

## R Markdown

### AAA
![](out.jpg)

### BBB
![](out1.jpg)

### CCC
![](out2.jpg)


 ```{r , echo=FALSE}  
 
read_png <- image_read("./test1.jpg")  
#cat("AAA")  
image_write(read_png, path="./out.jpg", format="jpeg")  

read_png <- image_read("./test1.jpg")  
#cat("BBB")  
image_write(read_png, path="./out1.jpg", format="jpeg")  

read_png <- image_read("./test1.jpg")  
#cat("CCC")  
image_write(read_png, path="./out2.jpg", format="jpeg")  

Comments

[退会済みユーザー]

markdown記法で書いていくという発想はありませんでした！
ありがとうございます！！