GAE Flexible EnvironmentアプリケーションをEclipseで作成したい

Question

お世話になっております。

現在Webアプリケーションを作成しようとしているのですが、Java8で開発したいと思い、GAE Flexible EnvironmentでSpring Bootを使用して開発したいと思っています。
本来であればStandardで保管できない部分をFlexibleで行うのが推奨されているようですが、Java8環境やSpringBootを使用する練習としてFlexibleで作成したいと考えています。

環境
Eclipse 4.6
JDK 1.8.45
Maven 3.3.9
Spring Tool Suite 3.8.3

公式ページにFlexible EnvironmentでSpring Bootアプリケーションの例があったのですが、Eclipseで開発する場合にどのようにしていいのか分かりませんでした。

Cloud Tools for Eclipseは導入しているのですがStandard Environmentしか開発できないようでした。
MavenProjectとしてStandard Environmentでのアップロードは何度か行った事があります。

Eclipseを使用してGAE Flexible Environmentでアプリケーションを作成している方いらっしゃいましたらご教示下さい。

宜しくお願い致します。