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Jupyter

Jupyter (旧IPython notebook)は、Notebook形式でドキュメント作成し、プログラムの記述・実行、その実行結果を記録するツールです。メモの作成や保存、共有、確認などもブラウザ上で行うことができます。

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Jupyter notebookの実行ができない+勝手に別の作業が始まる

Shinichi_k

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Jupyter

Jupyter (旧IPython notebook)は、Notebook形式でドキュメント作成し、プログラムの記述・実行、その実行結果を記録するツールです。メモの作成や保存、共有、確認などもブラウザ上で行うことができます。

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投稿2022/01/09 08:08

編集2022/01/09 12:31

前提・実現したいこと

リモート環境でjupyter notebookを使用しているのですが, セルの実行ができない上に,おかしな挙動を示しているので, この挙動を止めてセルを実行したいです。

発生している問題・エラーメッセージ

リモート環境でjupyter notebookを使用しているのですが, その環境で

jupyter notebook

と打ち, 表示されたURLをchromeで開くとjupyterの画面に飛ぶとこまでは問題なくできます。
しかし, notebookのファイルを作成し,セルを実行しようとしても,右上に"kernel starting please wait" と表示されて実行ができません。その上, このnotebookのファイルを開いた瞬間, ターミナル上では全く関係のない作業が勝手に実行され始め, その進捗状況が表示されていきます。
jupyterを閉じ, その作業も止めても,再度勝手に始まってしまいます。control+cで強制終了しても,再度この作業は始まり,止めることができません。

これまでは以上のような問題はなく,通常通りに実行できていたのですが, 年明けに久しぶり(約10日ぶり)に実行して見たところ,このような問題に行き当たりました。

リモート上のosはLinux version 3.10.0-1160.49.1.el7.x86_64
手元はmacOS 12.1 です。

以下はターミナル上での表示です。

bash-4.2$ jupyter notebook
[I 16:46:59.542 NotebookApp] Writing notebook server cookie secret to /run/user/1861/jupyter/notebook_cookie_secret
[W 16:47:00.065 NotebookApp] WARNING: The notebook server is listening on all IP addresses and not using encryption. This is not recommended.
[I 16:47:00.117 NotebookApp] JupyterLab extension loaded from /opt/local/Anaconda/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/jupyterlab
[I 16:47:00.118 NotebookApp] JupyterLab application directory is /opt/local/Anaconda/anaconda3/share/jupyter/lab
[I 16:47:00.124 NotebookApp] Serving notebooks from local directory: /home/kinoshitasn
[I 16:47:00.124 NotebookApp] The Jupyter Notebook is running at:
[I 16:47:00.124 NotebookApp] http://(an14 or 127.0.0.1):8080/?token=d99d57c8f62349f5e35a072594062adf270f500389010728
[I 16:47:00.124 NotebookApp] Use Control-C to stop this server and shut down all kernels (twice to skip confirmation).
[C 16:47:00.125 NotebookApp]

Copy/paste this URL into your browser when you connect for the first time, to login with a token: http://(an14 or 127.0.0.1):8080/?token=d99d57c8f62349f5e35a072594062adf270f500389010728

[I 16:47:12.774 NotebookApp] 302 GET /?token=d99d57c8f62349f5e35a072594062adf270f500389010728 (133.40.8.203) 0.73ms
[I 16:47:18.032 NotebookApp] Creating new notebook in
[W 16:47:19.111 NotebookApp] 404 GET /nbextensions/varInspector/main.js?v=20220109164659 (133.40.8.203) 11.60ms referer=http://an14:8080/notebooks/Untitled2.ipynb?kernel_name=python3
[W 16:47:19.114 NotebookApp] 404 GET /nbextensions/spellchecker/main.js?v=20220109164659 (133.40.8.203) 1.51ms referer=http://an14:8080/notebooks/Untitled2.ipynb?kernel_name=python3
[W 16:47:19.116 NotebookApp] 404 GET /nbextensions/codefolding/main.js?v=20220109164659 (133.40.8.203) 1.49ms referer=http://an14:8080/notebooks/Untitled2.ipynb?kernel_name=python3
[W 16:47:19.118 NotebookApp] 404 GET /nbextensions/scratchpad/main.js?v=20220109164659 (133.40.8.203) 1.49ms referer=http://an14:8080/notebooks/Untitled2.ipynb?kernel_name=python3
[W 16:47:19.121 NotebookApp] 404 GET /nbextensions/python-markdown/main.js?v=20220109164659 (133.40.8.203) 1.53ms referer=http://an14:8080/notebooks/Untitled2.ipynb?kernel_name=python3
[I 16:47:19.152 NotebookApp] Kernel started: 7769f20f-b8b1-487b-9e7e-8b291f53023d
[W 16:47:19.159 NotebookApp] 404 GET /nbextensions/widgets/notebook/js/extension.js?v=20220109164659 (133.40.8.203) 1.31ms referer=http://an14:8080/notebooks/Untitled2.ipynb?kernel_name=python3
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yt : [INFO ] 2022-01-09 16:47:39,490 Parameters: cosmological_simulation = 0.0

試したこと

ブラウザをsafariに変えてしましましたが,同様の現象が起こります。

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meg_

2022/01/09 11:48

> セルの実行ができない上に,おかしな挙動を示している 上記はjupyter notebookをインストールしたときからでしょうか?それとも以前は普通に動作していたが何かのきっかけで始まったのでしょうか? また、OS等の環境の情報を追記されると良いかと思います。
Shinichi_k

2022/01/09 12:32

コメント頂きありがとうございます。 ご質問頂いた点について追記致しました。 #### これまでは以上のような問題はなく,通常通りに実行できていたのですが, 年明けに久しぶり(約10日ぶり)に実行して見たところ,このような問題に行き当たりました。きっかけは分かりません。 リモート上のosはLinux version 3.10.0-1160.49.1.el7.x86_64 手元はmacOS 12.1 です。
meg_

2022/01/10 11:00

「リモート」とはどういう環境でしょうか?
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