前提・実現したいこと
こちら
の仮想環境を作るために試行錯誤をしてる段階です。
!あり、なしでやったのですが、うまくいきませんでした。
該当のソースコード
!conda env create -f environment.yml
試したこと
こちら
を参考にしたのですが、うまくいきませんでした。
補足情報(FW/ツールのバージョンなど)
ここにより詳細な情報を記載してください。
Python3 (3.7.4)
Jupyter Lab version 1.1.4
macbookpro 16
そもそも、Colabで実行するのであれば、Googleが用意した環境を使うのですから、「Jupyter Lab version 1.1.4」という表記は無意味だと思いますが、違いますか?
https://pypi.org/project/cellpose-napari/
に「a napari plugin for anatomical segmentation of general cellular images」って書いてあるので、これはnapariに組み込むプラグインですよね
napariが使える環境じゃないとプラグインを入れることはできないと思うのですが、そもそもGoogle Colabでnapariは動くのでしょうか?
https://github.com/napari/napari
の画像を見ると、GUIアプリっぽく見えるのですが
Google Colabでnapariが使えないなら、頑張ってGoogle ColabにAnaconda環境を入れて、そこにcellpose-napariをインストールすることができても、その努力が無駄に終わるような気がします
【追記】
napariのことをよく知らないので、的外れなことを書いてるかもしれません
napariがGUIではない使い方もできるもので、質問者さんがやりたい事がそれなら、このコメントは全くの的外れですので、スルーしてください
> /bin/bash: conda: command not found
そもそもconda環境(anaconda or miniconda)はインストール済なのでしょうか?
手順を教えていただけると幸いです。なにをやっても機能しません。
「手順を説明してくれ」は「代わりにやってくれ」と同義であり、丸投げです。
それに、どこが問題なのか分からないので、手順を教えてもそれが解消できない場合もあります。
また、あなたが提示した、検索結果の一番上にある以下のサイトでは、condaをインストールする手順が書かれています。
https://qiita.com/kimisyo/items/2b797c68a756c468e497
cellpose-napariのインストール手順も、あなたが提示したPyPiのサイトに書かれています。
ここら辺を見れば、手順は分かるはずです。
その上で上手くいかなかった場合は、具体的にやった手順をあなた自身が質問を編集して提示してください。
fiveHundredさん、meg_さんまことにありがとうございます。
手順どおりおこない、依存してるpythonのバージョンを変更してもできませんでした。githubで直接聞いてる次第です。
> 手順どおりおこない
Google Colabratoryの新規ノートブックを作成したあとの実際に質問者さんが行った「手順」を質問に追記してください。そうしてもらえば第三者が検証できるかと思います。
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