【docker環境構築】についてのエラー

Question

現状と問題

cloud9を用いて開発を行なっていたのですが、dockerで環境構築してvscodeで開発をできるようにしたいと思い、こちらの動画を参考に環境構築しました。
localhost:3000にアクセスをし、Your on Rails!の画面を表示させるところまではうまくいきました。
しかし、下記コマンドを行なってファイルが作られたのはいいのですが、modelなど中身のない空のファイルになります。

$ docker-compose run web rails new . --force --database=mysql --skip-bundle

そこで、今までcloud9で開発していたmodel,controller,view,routingなどのファイルをコピーしてdockerで環境構築したvscodeに持ってこようと考えました。
そして一通りファイルを移し終えて（dbに関してはマイグレーションファイルなどは移し替えませんでした。新たにrails g modelが必要？？）
gemファイルをいじったので

$ docker-compose build
$ docker-compose run web bundle install
//そしていよいよサーバーを立ち上げようと下記コマンド実行
$ docker-compose up    //ここでエラーが発生！！

エラーの内容は。。。

undefined method `devise' for User (call 'User.connection' to establish a connection):Class (NoMethodError)

ここでやっと気づいたのですが、deviseのgemやMVCに記述はしていますが、rails g devise installをしていませんでした。
しかしコマンドを打つと

Could not find mysql2-0.5.3 in any of the sources Run `bundle install` to install missing gems.

そこから色々コマンドを打つうちにmysql2が入っていないのではないかと思い、バージョンを確認したところ見つかりませんでした。
gemファイルやgemfilelockには記載されていましたが、なぜか見つからないと言われました。
rails newするときにサーバーでmysqlを指定しているのになぜかは分かりませんでしたが、しょうがないのでmysql2をインストールしようとしたところ、brew install mysqlをしろとターミナルに言われ、言う通りにするとmysql '8.0.27'がインストールされました。
ここら辺からエラーに続いて違う方向に行きすぎてパンクしてしまいました。。。
もしかしてと思い、rails g devise installをもう一度すると

can't find gem railties (>= 0.a) with executable rails (Gem::GemNotFoundException)

というエラーが出ました。

docker環境構築時の該当ファイル

version: "3"

services:
  db:
    image: mysql:5.7
    environment:
      MYSQL_USER: tomom
      MYSQL_ROOT_PASSWORD: password
    ports:
      - "3306:3306"
    volumes:
      - ./db/mysql/volumes:/var/lib/mysql

  web:
    build: .
    command: bash -c "rm -f tmp/pids/server.pid && bundle exec rails s -p 3000 -b '0.0.0.0'"
    volumes:
      - .:/myapp
      - gem_data:/usr/local/bundle
    ports:
      - 3000:3000
    depends_on:
      - db
    tty: true
    stdin_open: true

volumes:
  gem_data:

# MySQL. Versions 5.1.10 and up are supported.
#
# Install the MySQL driver
#   gem install mysql2
#
# Ensure the MySQL gem is defined in your Gemfile
#   gem 'mysql2'
#
# And be sure to use new-style password hashing:
#   https://dev.mysql.com/doc/refman/5.7/en/password-hashing.html
#
default: &default
  adapter: mysql2
  encoding: utf8
  pool: <%= ENV.fetch("RAILS_MAX_THREADS") { 5 } %>
  username: root
  password: password
  host: db

development:
  <<: *default
  database: myapp_development

# Warning: The database defined as "test" will be erased and
# re-generated from your development database when you run "rake".
# Do not set this db to the same as development or production.
test:
  <<: *default
  database: myapp_test

# As with config/secrets.yml, you never want to store sensitive information,
# like your database password, in your source code. If your source code is
# ever seen by anyone, they now have access to your database.
#
# Instead, provide the password as a unix environment variable when you boot
# the app. Read http://guides.rubyonrails.org/configuring.html#configuring-a-database
# for a full rundown on how to provide these environment variables in a
# production deployment.
#
# On Heroku and other platform providers, you may have a full connection URL
# available as an environment variable. For example:
#
#   DATABASE_URL="mysql2://myuser:mypass@localhost/somedatabase"
#
# You can use this database configuration with:
#
#   production:
#     url: <%= ENV['DATABASE_URL'] %>
#
production:
  <<: *default
  database: myapp_production
  username: myapp
  password: <%= ENV['MYAPP_DATABASE_PASSWORD'] %>

細かく切り出してエラーを解決していきたいのですが、お力添えいただけると大変ありがたいです。
必要なファイルや情報等言っていただければお答えしますので、どうかよろしくお願いいたします。

参考記事
こちら
こちら