タグを発行し利用者にウェブサイトにタグを張り付けもらって、mysqlから呼び出したデータを元に色々なものを表示するプログラムを開発しようと思った際の疑問

表題の件でございますが、上手い質問文が思い浮かばなかったため改めて疑問の詳細を述べさせて頂きます。

例えば、色々なウェブサイト・ブログ・ホームページ、これらに、
タグ発行されたものを張り付けるサービスは多々あると思います。

沢山ある広告のタグ、ランキングを表示するためのタグ、画像を表示するためのタグ、パーツを表示するためのタグなどです。
当方も、これらのような、タグを発行して利用者に利用をしてもらう、というサービスをプログラミングしたいと思いました。

Googleの広告タグを発行して、自身のサイト・サービスに貼り付けてもらう。
ランキング表示タグを発行して、自身のブログ・サイトに貼り付けてもらう。
などと同様に、今私が想定しているものは、タグ発行をして利用者に利用してもらおうというものです。
私のmysql（phpMyAdminでいつもは管理している）にあるデータから抽出して最終的に各利用者利用してもらえるものを作成しようと
試みている次第です。

そこで気付きましたのが、多くの広告サービスのタグであったり、その他のパーツのタグは最終的にこのようなタグを
発行すると思います。

javascript
1<script type="text/javascript" src="http～～～～～～～～～～～～.js"></script>

この時点で私の想像では、javascriptファイルにアクセスしてPHPのコードも書いてjavascriptも書いて、
最終的にmysqlから抽出してきたデータを元に、出力をしていくのかな、と思いました。

しかしここで、
＞javascriptファイルにアクセスしてPHPのコードも書いてjavascriptも書いて
という部分で、PHPでmysqlからデータを抽出してjavascriptで表示をしていく際に変数のやり取りなど戸惑い、
ajaxで通信をする、など色々出て混乱をして参りました。
node.jsでデータを管理するやり方等々とも情報は一応得ました。
（私は現在ajaxと、node.jsは扱ったことがない状態でございます…）。

自分のやり方をもう一度見直してみようと思いまして、

javascript
1<script type="text/javascript" src="http～～～～～～～～～～～～.php"></script>

と、phpファイルにパラメータなどつけてアクセスをして最終的に、

echo "document.write('出力したい内容');

などでこのまま進めれば、自分の思うようなプログラムを作成出来そうな気はして参りました。
しかしここで最終的に浮かんだ疑問をいくつかまとめさせて頂きたいと思います；申し訳ありません；。

タグ発行をさせて利用者に利用してもらうタイプのサービスは、<script type="text/javascript" src="http～～～～.js
jsファイルにアクセスするタグのタイプがphpにアクセスするタイプのものよりも多いと思いました。
10数通りほど、調べれるだけの広告タグのタイプですとか、ランキングパーツ的なものを調べましたが
8割くらいsrc=" jsファイル"　というものだったと個人的には感じました。

phpファイルにアクセスするタイプのタグのものは何かセキュリティ的にかんばしくない点があるのかどうか。
node.jsというものを勉強して、そちらでデータベースを作成したほうがよい？のかどうか。
node.jsを勉強でなく、　ajaxというものをマスターして、しっかり使いこなせば、

javascriptファイルから私のphpmyadminとうまく通信できるのか。

という点をお教え頂きたく思いました・・。
現状は、<script type="text/javascript" src="http～～～～～～～～～～～～.php"></script>　が少なくても
セキュリティ等に問題が無ければ、まずはこれで進めたいと思っている所存です。
乱文を申し訳ございません；宜しくご指導の程お願い致します；