学生で初心者です
ステップワイズ法によるQTL解析を行うときに以下のエラー:
No default penalties available for cross type bcsft
が出てしまいます。
cross type bcsftでモデルを構築するにはどうすればよいのでしょうか。
調べてみましたがわかりませんでした。
よろしくお願いいたします。
mapFunc <- "kosambi"
data <- read.cross("csvr", file="H257MBc1F4.csv", estimate.map=T, map.function=mapFunc, BC.gen=1, F.gen=4)
--Read the following data:
114 individuals
23 markers
73 phenotypes
--Estimating genetic map
--Cross type: bcsft
data.sim <- sim.geno(data,step=5, n.draws=128, map.function=mapFunc)
gr.sw <- stepwiseqtl(data.sim,pheno.col="gr", max.qtl=2)
stepwiseqtl(data.sim, pheno.col = "gr", max.qtl = 2) でエラー:
No default penalties available for cross type bcsft
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