jarファイルを.app化するとローカルのDBファイルを読み込めない

Question

JavaFXでメモアプリを作成しました。このアプリはsqliteでローカルにDBを持たせています。

これをjarファイルにして、さらにmacで起動できるように.app化したのですが、
内部の.dbファイルを読み込むことができないまま起動します。
またloggerを使ってデバッグしてみたのですが、logファイルも作成も吐き出されずにデバッグができませんでした。

Q1 アプリ化というか、.app化する場合、データとなるファイルの置き場所は決まっているか、アドバイス頂きたいです。

(以下のようにディレクトリを作成しました)
appのルートディレクトリ
-Contents
--MacOs
---jre(軽量化したもの)
---jarファイル(これが本体)
---main.command
---本来はここに.dbファイルが作成される
--Resources
--info.plist