まず、カレントディレクトリ、そしてパスこの二つが分かっていないと、どんな丁寧な説明をしても無駄です。
だって前提知識が欠けているから。
なので、「UNIX カレントディレクトリ とは」とかで検索しましょう。
プログラマやSEは『考える事』と「調べる事」が仕事です。
プログラマでないとしても、IT関係でやる以上、絶対です。
(ましてやUNIX系って余程のことが無い限り使わないでしょ)
カレントディレクトリやパスの説明は他のサイトに譲ります。
とりあえず、現在のカレントディレクトリを調べてみてください。
pwdコマンドを使うようです。
現在のカレントディレクトリがbinディレクトリがある場所で、そのサブディレクトリとして
binがあるというのなら、
でイケるはずです。(ファイル名は読みかえてください)
つまり、現在位置から bin/Main.class が見えるのならそのまま指定すればいいだけです。
でも、まったく別のところ ( 例1: /bin/javatest/sample, 例2: /test1/test2 ) だと、
そもそも呼び出せません。
相対パスやファイル名だけの場合、「カレントディレクトリにあるもの」か、
「パスが通っているところ」しかできません。
なので、
方法1: クラスパスを指定する
$ java -classpath <Mainクラスがあるディレクトリ> Main
または、
方法2: パスを通す
Main.class がある binディレクトリまでの絶対パスとかでパスを通し、
$ java Main
で起動
または、
方法3: カレントディレクトリを変更してから起動する
$ cd /bin
$ java Main
とかでしょうか。
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