ggsurvplotを使って生存分析をしています。カプランマイヤー曲線までは引けるのですが、ログランク検定やリスクテーブルを入れようとすると、途端にエラーメッセージがでてしまい、それに対応できません。原因について何かわかることがあればご教示願います。
ggsurvplot(KM, data = DT, censor.shape = "|", censor.size =2,
-
size =1,
-
palette = c("#e7B800","#2E9FDF"),
-
conf.int = TRUE)
ではうまくいくのですが、
ggsurvplot(KM, data = DT, censor.shape = "|", censor.size =2,
-
size =1,
-
palette = c("#e7B800","#2E9FDF"),
-
conf.int = TRUE,
-
pval = TRUE,
-
risk.table = TRUE,
-
risk.table.col = "strata")
bl_make_text_box(token, drawing_context$gp, drawing_context$yoff_pt) でエラー:
関数 'Rcpp_precious_remove' はパッケージ 'Rcpp' では提供されていません
となり、エラーに対処できません。
パッケージはtydyverse, survival, survminerが入っています。
KM <- survfit(Surv(`Survival months2`, Status) ~ Pref, data = DT) ggsurvplot(KM, data = DT) ggsurvplot(KM, data = DT, censor.shape = "|", censor.size =2) ggsurvplot(KM, data = DT, censor.shape = "|", censor.size =2, size =1, palette = c("#e7B800","#2E9FDF"), conf.int = TRUE) #pvalやrisk.tableいれようとするとエラー ggsurvplot(KM, data = DT, censor.shape = "|", censor.size =2, size =1, palette = c("#e7B800","#2E9FDF"), conf.int = TRUE, pval = TRUE, risk.table = TRUE, risk.table.col = "strata", legend.labs = c ("Restrictive","Liberal"), risk.tabke.height = 0.25, ggtheme = theme_bw() )
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