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R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

Q&A

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R studioにDESeq2のインストールができない

mikakona

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R

R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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投稿2021/07/12 15:18

前提・実現したいこと

ここに質問の内容を詳しく書いてください。
R studioにDESeq2をインストールするため、
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("DESeq2")
というコマンドを実行したところ、以下のようなエラーが出てしまいました。

発生している問題・エラーメッセージ

Error in unpackPkgZip(foundpkgs[okp, 2L], foundpkgs[okp, 1L], lib, libs_only, : ERROR: failed to create lock directory ‘C:/00LOCK’ In addition: Warning message: In .inet_warning(msg) : cannot create dir 'C:\', reason 'Permission denied'

該当のソースコード

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("DESeq2")

試したこと

Rを最新版にする、管理者権限で常に実行、ディレクトリの確認、アプリケーションの再起動

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

ここにより詳細な情報を記載してください。

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KojiDoi

2021/07/13 06:42

Rというよりwindowsの問題のように思えます。C:に書き込みしようとして失敗しているようですが、当該ドライブ/フォルダの権限設定はどうなっていますか? windowsの場合、所有者を正しく設定しないと管理者でも書き込み出来なくなる場合がありますが、そこは大丈夫ですか?
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