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MPI

MPIは、並列プログラミングを利用するための標準化規格、及び実装自体のことを指します。バイト列で構成されたメッセージとして、いくつかのCPUが情報を送受信することにより協調動作を可能にします。

Linux

Linuxは、Unixをベースにして開発されたオペレーティングシステムです。日本では「リナックス」と呼ばれています。 主にWebサーバやDNSサーバ、イントラネットなどのサーバ用OSとして利用されています。 上位500のスーパーコンピュータの90%以上はLinuxを使用しています。 携帯端末用のプラットフォームAndroidは、Linuxカーネル上に構築されています。

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mpirunでexited on signal 11 (Segmentation fault).

toku16

総合スコア0

MPI

MPIは、並列プログラミングを利用するための標準化規格、及び実装自体のことを指します。バイト列で構成されたメッセージとして、いくつかのCPUが情報を送受信することにより協調動作を可能にします。

Linux

Linuxは、Unixをベースにして開発されたオペレーティングシステムです。日本では「リナックス」と呼ばれています。 主にWebサーバやDNSサーバ、イントラネットなどのサーバ用OSとして利用されています。 上位500のスーパーコンピュータの90%以上はLinuxを使用しています。 携帯端末用のプラットフォームAndroidは、Linuxカーネル上に構築されています。

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投稿2021/06/11 04:46

編集2021/06/11 04:48

前提・実現したいこと

fedora33でlammpsを実行し、分子動力学シミュレーションを行っています。
mpirun -np 10 lmp_openmpi -in (実行ファイル名) で実行すると途中(プログラムの1/3程度)までは問題なく進み、その後以下のエラーメッセージが表示されます。

発生している問題・エラーメッセージ

Primary job terminated normally, but 1 process returned a non-zero exit code. Per user-direction, the job has been aborted. mpirun noticed that process rank 7 with PID 0 on node localhost exited on signal 11 (Segmentation fault).

試したこと

プログラムの再確認、lammpsの再インストールを行いましたが、改善しないため解決方法を教えていただけると幸いです。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

ここにより詳細な情報を記載してください。
以下、PCの情報です。
OS:fedora33
メモリ:64GB
プロセッサー:Intel® Core™ i9-10900 CPU @ 2.80GHz × 20
ディスク容量:1.4TB

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