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Windows 10は、マイクロソフト社がリリースしたOSです。Modern UIを標準画面にした8.1から、10では再びデスクトップ主体に戻され、UIも変更されています。PCやスマホ、タブレットなど様々なデバイスに幅広く対応していることが特徴です。

R

R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

Q&A

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ballgown実行の際に出るエラーメッセージ”invalid 'row.names' length”を解決したい

shinzan

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Windows 10

Windows 10は、マイクロソフト社がリリースしたOSです。Modern UIを標準画面にした8.1から、10では再びデスクトップ主体に戻され、UIも変更されています。PCやスマホ、タブレットなど様々なデバイスに幅広く対応していることが特徴です。

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R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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投稿2021/05/13 10:22

前提・実現したいこと

Rのballgownを使って遺伝子の発現量を比較したいと思っています。

発生している問題・エラーメッセージ

Thu May 13 18:48:43 2021 Thu May 13 18:48:43 2021: Reading linking tables `.rowNamesDF<-`(x, value = value) でエラー: invalid 'row.names' length

###このようにしてballgownをインストールしました

R

1install.packages("BiocManager") 2BiocManager::install("ballgown") 3 4install.packages('metaMA') 5library(metaMA) 6 7install.packages('tidyr') 8library(tidyr) 9 10install.packages('dplyr') 11library(dplyr) 12library(ballgown)

該当のソースコード

R

1data_info <- read.csv("ballgown/data_info.csv") 2bg <- ballgown(dataDir = "ballgown", pData=data_info, samplePattern = "SRR") 3

試したこと

ソースコードの"<-"の部分を=で記述しても同じエラーが出た。
検索はしたが有効な解決策はなかった。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

最新のWindows10pro
R version 4.0.5 (2021-03-31)

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