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バッチファイルからrunipyが実行できない

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やりたいこと

バッチファイル(.shファイル)内で、runipyを使ってjupyter notebookを自動実行したい。

環境

  • OS:macOS Big Sur ver 11.2.3
  • python3.8
  • runipy         0.1.5
  • jupyter core     : 4.6.3
  • jupyter-notebook : 6.1.1
  • qtconsole        : not installed
  • ipython          : 7.17.0
  • ipykernel        : 5.3.4
  • jupyter client   : 6.1.6
  • jupyter lab      : 2.2.2
  • nbconvert        : 5.6.1
  • ipywidgets       : not installed
  • nbformat         : 5.0.7
  • traitlets        : 4.3.3

できないこと

runipy test.ipynb out.ipynbと書いたバッチファイルをcronで定期実行しようとすると、
test.sh: line 4: runipy: command not foundと表示され、実行できない状況です。
なにかご存知でしたら、教えていただきたいです。

runipy test.ipynb out.ipynbをターミナル上から実行すると、jupyter notebookが更新されます。
バッチファイル上から実行すると、上記のエラーが発生してしまいます。

バッチファイルの中身は以下の通りです。

#!/bin/sh
cd <.ipynbのあるディレクトリ>
runipy test.ipynb out.ipynb 

以上です。よろしくお願いいたします。

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  • jbpb0

    2021/03/24 12:29

    runipyが置かれているパスが、cronでの実行状態では環境変数PATHに含まれてなくて、見つからないのかもしれません

    cronで実行するシェルスクリプト(質問でバッチファイルと書かれているもの)内の「runipy」を、コマンド単独ではなく絶対パスで書けば、動くかもしれません
    絶対パスは、ターミナルで
    which runipy
    を実行したら分かります
    https://kanonji.hatenadiary.com/entry/20100210/1265828299

    あるいは、cronで実行するシェルスクリプトの、「runipy」を実行するところよりも前(上)に、
    export PATH=$PATH:runipyが置かれているパス
    を追加すれば、動くかもしれません
    https://qiita.com/soarflat/items/d5015bec37f8a8254380

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