Dockerを使用してPyTorchやGPUを使用できる環境を構築する際に発生したエラー

こちらのQiitaの記事を参考に,Dockerを作成してPyTorchやGPUを使用できる環境を構築しようと考えました．

https://qiita.com/radiol/items/48909d69ba8114edcbf2

しかし,Dockefileをbuildした際にエラーが生じたため,質問させていただきます.

実行したDockerfileは以下です.

Dockerfile
1FROM pytorch/pytorch:latest
2
3# Install required libraries
4RUN conda config --add channels pytorch \
5 && conda config --append channels conda-forge \
6 && conda update --all --yes --quiet \
7 && conda install --yes --quiet \
8    ipywidgets \
9    jupyterlab \
10    matplotlib \
11    nodejs \
12    opencv \
13    pandas \
14    scikit-learn \
15    seaborn \
16    sympy \
17 && conda clean --all -f -y
18
19RUN conda install nodejs
20
21# Install jupyter extensions
22RUN jupyter nbextension enable --py --sys-prefix widgetsnbextension \
23 && jupyter labextension install @jupyter-widgets/jupyterlab-manager
24
25COPY jupyter_notebook_config.py /root/.jupyter/

しかし,stepの4つ目にエラーがあるようで,

terminal
1Step 4/5 : RUN jupyter nbextension enable --py --sys-prefix widgetsnbextension  && jupyter labextension install @jupyter-widgets/jupyterlab-manager
2 ---> Running in c168eafeaa10
3Enabling notebook extension jupyter-js-widgets/extension...
4      - Validating: OK
5An error occured.
6ValueError: Please install nodejs >=12.0.0 before continuing. nodejs may be installed using conda or directly from the nodejs website.
7See the log file for details:  /tmp/jupyterlab-debug-oka783ye.log
8The command '/bin/sh -c jupyter nbextension enable --py --sys-prefix widgetsnbextension  && jupyter labextension install @jupyter-widgets/jupyterlab-manager' returned a non-zero code: 1

と出てきました.

Qiitaの記事にnodejsをインストールする箇所がなくそれを直せば良いと考えたのですが,3つ目にnodejsをinstallしてもこの問題は解決されませんでした.

どうすればこちらのエラーは解消されるかご教授していただけると幸いです.

また,環境構築に関して他の方法等ございましたらご教授していただけると幸いです

t_obara

2021/03/23 07:04

「Qiitaの記事にnodejsをインストールする箇所がなく」とありますが、matplotlibの後に記載されていますよね。nodejsのバージョンを確認するとか、nodejsをcondaではない方法で入れてみてはいかがでしょうか。

unser

2021/03/23 13:18

ご回答いただきありがとうございます. 確かに,nodejsを入れている状態ではありますね. nodejsのversionはどのようにして指定したら良いかご教授していただけると幸いです.

行動規範の内容に同意します

回答1件

ベストアンサー

ひとつめのRUN ... conda install ...の中に nodejs も入っているので、
追加の RUN conda install nodejs しても変わりません。

おそらく、ちゃんと nodejs はインストールされているけど、古いバージョンなんだと思います。
詳しく知らないですが、ライブラリのバージョンの依存関係で古いものがインストールされるようです。
(多分 ver 6.xx ぐらいのが入っているかと)

以下のようにバージョン指定してインストールしてやると、うまくいかないでしょうか？

Dockerfile
1FROM pytorch/pytorch:latest
2
3# Install required libraries
4RUN conda config --add channels pytorch \
5 && conda config --append channels conda-forge \
6 && conda update --all --yes --quiet \
7 && conda install --yes --quiet \
8    ipywidgets \
9    jupyterlab \
10    matplotlib \
11    "nodejs>=12.0" \
12    opencv \
13    pandas \
14    scikit-learn \
15    seaborn \
16    sympy \
17 && conda clean --all -f -y
18
19# Install jupyter extensions
20RUN jupyter nbextension enable --py --sys-prefix widgetsnbextension \
21 && jupyter labextension install @jupyter-widgets/jupyterlab-manager
22
23COPY jupyter_notebook_config.py /root/.jupyter/