cloud9でmysqlと接続することができない

Question

実現したいこと

aws初心者
cloud9にmysqlをインストールし、mysqlを使える環境で開発をしたい。

・

現状

容量が足りておらずサーバーをインストールできていなかったようなので
容量を追加し、サーバーがインストールできました。

$ sudo yum install mysql-server

Loaded plugins: extras_suggestions, langpacks, priorities, update-motd

amzn2-core | 3.7 kB 00:00:00
263 packages excluded due to repository priority protections
Package mysql-community-server-8.0.23-1.el7.x86_64 already installed and latest version
Nothing to do

$ mysql --version

mysql Ver 8.0.23 for Linux on x86_64 (MySQL Community Server - GPL)

発生している問題

$ systemctl status mysqld.service

● mysqld.service - MySQL Server

Loaded: loaded (/usr/lib/systemd/system/mysqld.service; enabled; vendor preset: disabled)
Active: failed (Result: exit-code) since Sat 2021-02-06 04:37:47 UTC; 13s ago
Docs: man:mysqld(8)
http://dev.mysql.com/doc/refman/en/using-systemd.html
Process: 17375 ExecStart=/usr/sbin/mysqld $MYSQLD_OPTS (code=exited, status=1/FAILURE)
Process: 17289 ExecStartPre=/usr/bin/mysqld_pre_systemd (code=exited, status=0/SUCCESS)
Main PID: 17375 (code=exited, status=1/FAILURE)
Status: "Server startup in progress"
Error: 13 (Permission denied)
Feb 06 04:37:47 ip-172-31-37-66.ap-southeast-1.compute.internal mysqld_pre_systemd[17289]: 2021-0...
Feb 06 04:37:47 ip-172-31-37-66.ap-southeast-1.compute.internal mysqld_pre_systemd[17289]: 2021-0...
Feb 06 04:37:47 ip-172-31-37-66.ap-southeast-1.compute.internal mysqld[17375]: 2021-02-06T04:37:4...
Feb 06 04:37:47 ip-172-31-37-66.ap-southeast-1.compute.internal mysqld[17375]: 2021-02-06T04:37:4...
Feb 06 04:37:47 ip-172-31-37-66.ap-southeast-1.compute.internal mysqld[17375]: 2021-02-06T04:37:4...
Feb 06 04:37:47 ip-172-31-37-66.ap-southeast-1.compute.internal mysqld[17375]: 2021-02-06T04:37:4...
Feb 06 04:37:47 ip-172-31-37-66.ap-southeast-1.compute.internal systemd[1]: mysqld.service: main ...
Feb 06 04:37:47 ip-172-31-37-66.ap-southeast-1.compute.internal systemd[1]: Failed to start MySQL...
Feb 06 04:37:47 ip-172-31-37-66.ap-southeast-1.compute.internal systemd[1]: Unit mysqld.service e...
Feb 06 04:37:47 ip-172-31-37-66.ap-southeast-1.compute.internal systemd[1]: mysqld.service failed.
Hint: Some lines were ellipsized, use -l to show in full.

となったので、
この記事を参考に起動ログを確認

sudo vi /var/log/mysqld.log

2021-02-06T04:19:01.653849Z 0 [System] [MY-013169] [Server] /usr/sbin/mysqld (mysqld 8.0.23) initializing of server in progress as process 15948

2021-02-06T04:19:01.655447Z 0 [ERROR] [MY-010457] [Server] --initialize specified but the data directory has files in it. Aborting.
2021-02-06T04:19:01.655475Z 0 [ERROR] [MY-013236] [Server] The designated data directory /var/lib/mysql/ is unusable. You can remove all files that the server added to it.
2021-02-06T04:19:01.655552Z 0 [ERROR] [MY-010119] [Server] Aborting
2021-02-06T04:19:01.655679Z 0 [System] [MY-010910] [Server] /usr/sbin/mysqld: Shutdown complete (mysqld 8.0.23) MySQL Community Server - GPL.

/var/lib/mysql/が使用できないと書かれているようなので、下記コマンドで削除してもう一度試してみても変わりなしです。。

sudo rm -rf /var/lib/mysql

less /var/log/mysqld.log

2021-02-06T02:57:16.556954Z 0 [System] [MY-013169] [Server] /usr/sbin/mysqld (mysqld 8.0.23) initializing of server in progress as process 10685

2021-02-06T02:57:16.558684Z 0 [ERROR] [MY-010457] [Server] --initialize specified but the data directory has files in it. Aborting.
2021-02-06T02:57:16.558710Z 0 [ERROR] [MY-013236] [Server] The designated data directory /var/lib/mysql/ is unusable. You can remove all files that the server added to it.
2021-02-06T02:57:16.558771Z 0 [ERROR] [MY-010119] [Server] Aborting
2021-02-06T02:57:16.558895Z 0 [System] [MY-010910] [Server] /usr/sbin/mysqld: Shutdown complete (mysqld 8.0.23) MySQL Community Server - GPL.

やはり/var/lib/mysql/についてのエラーが出るので/var/libからmysqlを削除してみて
削除できたことを確認後、もう一度実行しましたが同じエラーになったので起動ログをみてみましたが変わりなしです。

その他試してみたこと

$ journalctl -xe

-- Unit mysqld.service has begun starting up.

Feb 06 05:43:35 ip-xxx.ap-southeast-1.compute.internal mysqld[21612]: 2021-02-06T05:43:35.277076Z 0 [System] [MY-010116]
Feb 06 05:43:35 ip-xxx.ap-southeast-1.compute.internal mysqld[21612]: 2021-02-06T05:43:35.279385Z 0 [ERROR] [MY-010187] [
Feb 06 05:43:35 ip-xxx.ap-southeast-1.compute.internal mysqld[21612]: 2021-02-06T05:43:35.280569Z 0 [ERROR] [MY-010119] [
Feb 06 05:43:35 ip-xxx.ap-southeast-1.compute.internal mysqld[21612]: 2021-02-06T05:43:35.280726Z 0 [System] [MY-010910]
Feb 06 05:43:35 ip-xxx.ap-southeast-1.compute.internal sudo[21540]: pam_unix(sudo:session): session closed for user root
Feb 06 05:43:35 ip-xxx.ap-southeast-1.compute.internal systemd[1]: mysqld.service: main process exited, code=exited, stat
Feb 06 05:43:35 ip-xxx.ap-southeast-1.compute.internal systemd[1]: Failed to start MySQL Server.
-- Subject: Unit mysqld.service has failed
-- Defined-By: systemd
-- Support: http://lists.freedesktop.org/mailman/listinfo/systemd-devel

-- Unit mysqld.service has failed.

-- The result is failed.
Feb 06 05:43:35 ip-xxx.ap-southeast-1.compute.internal systemd[1]: Unit mysqld.service entered failed state.
Feb 06 05:43:35 ip-xxx.ap-southeast-1.compute.internal systemd[1]: mysqld.service failed.

この他にもエラーを元に様々なブログを読みは試しを繰り返しましたが、お手上げ状態です、、

ここまで読んでいただきありがとうございました。
ご回答いただけますと幸いですm(_ _)m

Comments

[yu_1985]

どうやってインストールしましたか？
あと、MariaDBではダメな理由は何でしょう？

[mocha1325]

ご質問いただきありがとうございます！！

インストール方法はリンク貼らせていただいた方の方法で
$ sudo yum install -y httpd mysql
としました！
理由は本番環境がmysqlのため、できるだけ本番環境に近づけたいからです。

mysqlは手間がかかると承知の上でmysqlで進めたく考えています????????‍♀️
よろしくお願いいたします。

[yukky1201]

回答ですでにmysql-community-serverが無いとしてきありますが、

https://qiita.com/miriwo/items/e7afd5e1ae0de94f27c2
こちらのサイトのno26でパッケージ不足しているのでインストールしていますよ。

[mocha1325]

コメントいただきありがとうございます！
no26でインストールしたつもりになっていたようなのですが、見返してみると最後にこのようなエラー文が書かれており、正式にインストールされていなかったようです????????‍♀️
もし、この際の解決方法ご存知でしたらご教示いただけますと幸いですm(_ _)m

Transaction check error:
file /etc/my.cnf from install of mysql-community-server-8.0.23-1.el7.x86_64 conflicts with file from package mariadb-config-3:10.2.10-2.amzn2.0.3.x86_64
installing package mysql-community-server-8.0.23-1.el7.x86_64 needs 2062MB on the / filesystem

Error Summary
-------------
Disk Requirements:
At least 2062MB more space needed on the / filesystem.

[yukky1201]

mariadbのremoveもno1に書かれてます

[mocha1325]

こちらも試してみたのですが、no4で出力が出ないと書いているのに
下記のようになってしまいます。
jemalloc.x86_64 3.6.0-1.amzn2.0.1 @amzn2extra-lamp-mariadb10.2-php7.2
php-cli.x86_64 7.2.24-1.amzn2.0.1 @amzn2extra-lamp-mariadb10.2-php7.2
php-common.x86_64 7.2.24-1.amzn2.0.1 @amzn2extra-lamp-mariadb10.2-php7.2
php-devel.x86_64 7.2.24-1.amzn2.0.1 @amzn2extra-lamp-mariadb10.2-php7.2
php-fpm.x86_64 7.2.24-1.amzn2.0.1 @amzn2extra-lamp-mariadb10.2-php7.2
php-json.x86_64 7.2.24-1.amzn2.0.1 @amzn2extra-lamp-mariadb10.2-php7.2
php-mysqlnd.x86_64 7.2.24-1.amzn2.0.1 @amzn2extra-lamp-mariadb10.2-php7.2
php-pdo.x86_64 7.2.24-1.amzn2.0.1 @amzn2extra-lamp-mariadb10.2-php7.2
php-process.x86_64 7.2.24-1.amzn2.0.1 @amzn2extra-lamp-mariadb10.2-php7.2
php-xml.x86_64 7.2.24-1.amzn2.0.1 @amzn2extra-lamp-mariadb10.2-php7.2

Answer 1

その手順でインストールされるのはクライアントのみで、肝心のmysql-serverがインストールされていません。
下記でインストール出来るはずです。（念の為、mysql80-communityのリポジトリからインストールしようとしていることを確認してからインストールすることをおすすめします）

sudo yum install mysql-server

Comments

[mocha1325]

ご回答ありがとうございます！
早速試してみたところこのようになったのですが、その他の使わなそうなファイルなどを消去しなくてはならない、ということでしょうか、、？

$ sudo yum install mysql-server
Loaded plugins: extras_suggestions, langpacks,
: priorities, update-motd
263 packages excluded due to repository priority protections
Resolving Dependencies
--> Running transaction check
---> Package mysql-community-server.x86_64 0:8.0.23-1.el7 will be installed
--> Finished Dependency Resolution

Dependencies Resolved
=================================================
Package
Arch Version Repository Size
=================================================
Installing:
mysql-community-server
x86_64 8.0.23-1.el7 mysql80-community 518 M
Transaction Summary
=================================================
Install 1 Package

Total size: 518 M
Installed size: 2.4 G
Is this ok [y/d/N]: y
Downloading packages:
Running transaction check
Running transaction test

Transaction check error:
file /etc/my.cnf from install of mysql-community-server-8.0.23-1.el7.x86_64 conflicts with file from package mariadb-config-3:10.2.10-2.amzn2.0.3.x86_64
installing package mysql-community-server-8.0.23-1.el7.x86_64 needs 2118MB on the / filesystem

Error Summary
-------------
Disk Requirements:
At least 2118MB more space needed on the / filesystem.

[yu_1985]

mariadbとconflictしてるようなのでmariadbの関連パッケージを全部消してみたらどうでしょうかね。
sudo remove mariadb*
my.cnfだけがconflictしてるのかもしれませんが。

[mocha1325]

ご返事んありがとうございます????
$ sudo remove mariadb*
sudo: remove: command not found
試してみたところ上記のようになってしまいました。。
何度もお時間お取りしてしまい申し訳ないのですが解決方法ご存知でしたらご教授いただけたいですm(_ _)m

[yu_1985]

すいません
sudo yum remove mariadb*
ですね

[mocha1325]

ありがとうございます！
実行はできたのですが、まだエラーが出てしまっています。

$ sudo yum remove mariadb*
Loaded plugins: extras_suggestions, langpacks, priorities, update-motd
No Match for argument: mariadb*
No Packages marked for removal

$ sudo yum install mysql-server
Loaded plugins: extras_suggestions, langpacks, priorities, update-motd
amzn2-core | 3.7 kB 00:00:00
263 packages excluded due to repository priority protections
Resolving Dependencies
--> Running transaction check
---> Package mysql-community-server.x86_64 0:8.0.23-1.el7 will be installed
--> Finished Dependency Resolution

Dependencies Resolved

====================================================================================================
Package Arch Version Repository Size
====================================================================================================
Installing:
mysql-community-server x86_64 8.0.23-1.el7 mysql80-community 518 M

Transaction Summary
====================================================================================================
Install 1 Package

Total size: 518 M
Installed size: 2.4 G
Is this ok [y/d/N]: y
Downloading packages:
Running transaction check
Running transaction test

Transaction check error:
installing package mysql-community-server-8.0.23-1.el7.x86_64 needs 2116MB on the / filesystem

Error Summary
-------------
Disk Requirements:
At least 2116MB more space needed on the / filesystem.

[yu_1985]

ディスク容量不足です。Cloud9のEC2インスタンスのルートボリュームを拡張するのが最も手っ取り早いです。
EBSの拡張はコンソールからできます。
それだけではダメで、EBSの拡張後にファイルシステムの拡張をする必要があります。
https://docs.aws.amazon.com/ja_jp/AWSEC2/latest/UserGuide/recognize-expanded-volume-linux.html

[mocha1325]

ご丁寧に感謝します！！おかげさまでサーバーインストールができましたm(_ _)m
その後また別のエラーが出てしまい、色々試してみたのですが、解決方法が見つからず、
質問文を編集したしましたのでご回答いただけますと大変有り難いです????????????‍♀️
https://teratail.com/questions/320660

[yu_1985]

もはや完全に別の質問では…。
さすがに元の質問を全消しして別の質問にしてはダメでしょう。
元に質問を復元して追記する形にするか、別質問として立てるかどちらかにしたほうがよいです。

[yu_1985]

そして、追記した分はただstatusを見ているだけなので、そもそもstartしましたか？というところから聞きたいです。

[mocha1325]

すみません！新たに同じような質問を作成するのが禁止なようで、題名を抽象的に書いてしまったためダメなのかと思い編集してしまいました????????‍♀️新しく立てます！！

説明に不足がありすみません。
$ sudo service mysqld start
Redirecting to /bin/systemctl start mysqld.service
Job for mysqld.service failed because the control process exited with error code. See "systemctl status mysqld.service" and "journalctl -xe" for details.

startしようとすると上記のようになったため
$systemctl status mysqld.service
から書かせていただきました！????????‍♀️

Answer 2

mysqlのクライアントはインストール済みのようですが
サーバ（mysql-community-server***）がインストールされていないように見えます

Comments

[mocha1325]

ご回答ありがとうございます！
おっしゃる通りインストールしたつもりができていなかったようです。
このようになってしまっていたのですが、このような場合はインストールできないのでしょうか、、？
お手数おかけして申し訳ないのですが、ご教示いただけると幸いですm(_ _)m
$ sudo yum install mysql-server
Loaded plugins: extras_suggestions, langpacks,
: priorities, update-motd
263 packages excluded due to repository priority protections
Resolving Dependencies
--> Running transaction check
---> Package mysql-community-server.x86_64 0:8.0.23-1.el7 will be installed
--> Finished Dependency Resolution

Dependencies Resolved
=================================================
Package
Arch Version Repository Size
=================================================
Installing:
mysql-community-server
x86_64 8.0.23-1.el7 mysql80-community 518 M
Transaction Summary
=================================================
Install 1 Package

Total size: 518 M
Installed size: 2.4 G
Is this ok [y/d/N]: y
Downloading packages:
Running transaction check
Running transaction test

Transaction check error:
file /etc/my.cnf from install of mysql-community-server-8.0.23-1.el7.x86_64 conflicts with file from package mariadb-config-3:10.2.10-2.amzn2.0.3.x86_64
installing package mysql-community-server-8.0.23-1.el7.x86_64 needs 2118MB on the / filesystem

Error Summary
-------------
Disk Requirements:
At least 2118MB more space needed on the / filesystem.

[AbeTakashi]

Disk Requirements:
At least 2118MB more space needed on the / filesystem.

と書いてありますので、ストレージの容量を増やさないと無理なんでしょうね
聞く前にエラーメッセージをちゃんと読むようにした方が良いと思います。

[mocha1325]

無事サーバーインストールまでは出来ました！
こちらについては一度cloud9を消す前に自力で容量らしき部分を触ってみたのですが解決出来なかったので質問させていただきました????????‍♀️
せっかくご回答いただいたのに不愉快な思いにさせてしまっていたら申し訳ございませんでした????????‍♀️????????‍♀️