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R

R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

統計

統計は、集団現象を数量で把握することです。また、調査で得られた性質や傾向を数量的に表したデータのことをいいます。

Q&A

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Rを使用してカプランマイヤー曲線を作成したいです。

aiueowaon

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R

R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

統計

統計は、集団現象を数量で把握することです。また、調査で得られた性質や傾向を数量的に表したデータのことをいいます。

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投稿2020/12/21 06:57

前提・実現したいこと

R を使用しています。
カプランマイヤー曲線が表示されません。
何がエラーなのかご教示いただきたいです。

発生している問題・エラーメッセージ

#####(Logrank検定)#####

library(survival, pos=18)

km <- NULL

km.summary.table <- NULL

km <- survfit(Surv((PFS/1),PFS.イベント1.打ち切り0==1)~GnP.FFX.0.S.1.GEM.1, data=Dataset,

  • na.action = na.omit, conf.type="log-log")

summary(km)

Length Class Mode
0 NULL NULL

len <- nchar("GnP.FFX.0.S.1.GEM.1")

legend <- substring(names(km$strata), len+2)

quartz(width=7, height=7); par(lwd=1, las=1, family="sans", cex=1, mgp=c(2.5,1,0))

mar <- par("mar")

mar[1] <- mar[1] + length(km$strata) + 0.5

mar[2] <- mar[2] + 2

par(mar=mar)

opar <- par(mar = mar)

on.exit(par(opar))

plot(km, bty="l", col=1:32, lty=1, lwd=1, conf.int=FALSE, mark.time=TRUE, xlab="PFS",

  • ylab="Probability")

xticks <- axTicks(1)

n.atrisk <- nrisk(km, xticks)

for (i in 1:length(km$strata)){axis(1, at = xticks, labels = n.atrisk[i,], line=3+i, tick

  • = FALSE)}

for (i in 1:length(km$strata)){mtext(legend[i], at=-(xticks[2]-xticks[1])/2, side=1,

  • line=4+i, cex=1)}

title(xlab = "Number at risk", line = 3.5, adj = 0)

legend ("topright", legend, col=1:32, lty=1, lwd=1, box.lty=0,

  • title="GnP.FFX.0.S.1.GEM.1")

res <- NULL

(res <- survdiff(Surv(PFS,PFS.イベント1.打ち切り0==1)~GnP.FFX.0.S.1.GEM.1, data=Dataset, rho=0,

  • na.action = na.omit))

km.summary.table <- summary.km(survfit=km, survdiff=res)

km.summary.table

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KojiDoi

2020/12/21 08:01

グラフ画像出力用の作図デバイスの設定はどうなっているのでしょうか。
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