前提・実現したいこと
R を使用しています。
カプランマイヤー曲線が表示されません。
何がエラーなのかご教示いただきたいです。
発生している問題・エラーメッセージ
#####(Logrank検定)#####
library(survival, pos=18)
km <- NULL
km.summary.table <- NULL
km <- survfit(Surv((PFS/1),PFS.イベント1.打ち切り0==1)~GnP.FFX.0.S.1.GEM.1, data=Dataset,
- na.action = na.omit, conf.type="log-log")
summary(km)
Length Class Mode
0 NULL NULL
len <- nchar("GnP.FFX.0.S.1.GEM.1")
legend <- substring(names(km$strata), len+2)
quartz(width=7, height=7); par(lwd=1, las=1, family="sans", cex=1, mgp=c(2.5,1,0))
mar <- par("mar")
mar[1] <- mar[1] + length(km$strata) + 0.5
mar[2] <- mar[2] + 2
par(mar=mar)
opar <- par(mar = mar)
on.exit(par(opar))
plot(km, bty="l", col=1:32, lty=1, lwd=1, conf.int=FALSE, mark.time=TRUE, xlab="PFS",
- ylab="Probability")
xticks <- axTicks(1)
n.atrisk <- nrisk(km, xticks)
for (i in 1:length(km$strata)){axis(1, at = xticks, labels = n.atrisk[i,], line=3+i, tick
- = FALSE)}
for (i in 1:length(km$strata)){mtext(legend[i], at=-(xticks[2]-xticks[1])/2, side=1,
- line=4+i, cex=1)}
title(xlab = "Number at risk", line = 3.5, adj = 0)
legend ("topright", legend, col=1:32, lty=1, lwd=1, box.lty=0,
- title="GnP.FFX.0.S.1.GEM.1")
res <- NULL
(res <- survdiff(Surv(PFS,PFS.イベント1.打ち切り0==1)~GnP.FFX.0.S.1.GEM.1, data=Dataset, rho=0,
- na.action = na.omit))
km.summary.table <- summary.km(survfit=km, survdiff=res)
km.summary.table
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