atom script ディレクトリ入力一覧 削除方法

Question

atomのディレクトリ入力に失敗しまくったせいで入力の一覧がたくさん増えてしまい、
邪魔なので削除したいのですが削除出来ません。deleteから消そうとして、メッセージに「はい」と答えても消えません。
とくに絶対消さないといけない訳でもないのですが、どうにも気になって仕方がないです。なにか特別な!消し方があるのでしょうか？