ENOENT: no such file or directory エラー

centOS7上で
$[vagrant@localhost hubot-study] yo hubot --owner="OWNER <owner@example.com>" --name="TestBot" --description="Test Bot" --adapter=slack(ownerは自分のメールアドレス)
を打ったところ、以下の結果となりました。
ディレクトリ以下に既にpackage.jsonが存在するのに、別のpackage.jsonがないというエラーになっているのか、また、この場合どうすれば解決ができるのか教えていただけないでしょうか。

bash
1                     _____________________________  
2                    /                             \ 
3   //\              |      Extracting input for    |
4  ////\    _____    |   self-replication process   |
5 //////\  /_____\   \                             / 
6 ======= |[^_/\_]|   /----------------------------  
7  |   | _|___@@__|__                                
8  +===+/  ///     \_\                               
9   | |_\ /// HUBOT/\                             
10   |___///      /  \                            
11         \      /   +---+                            
12          \____/    |   |                            
13           | //|    +===+                            
14            //      |xx|                            
15
16identical bin/hubot
17identical bin/hubot.cmd
18identical Procfile
19identical README.md
20identical external-scripts.json
21identical hubot-scripts.json
22identical .gitignore
23 conflict package.json
24? Overwrite package.json? overwrite
25    force package.json
26identical scripts/example.coffee
27identical .editorconfig
28                     _____________________________  
29 _____              /                             \ 
30 \    \             |   Self-replication process   |
31 |    |    _____    |          complete...         |
32 |__\|   /_____\   \     Good luck with that.    / 
33   |//+  |[^_/\_]|   /----------------------------  
34  |   | _|___@@__|__                                
35  +===+/  ///     \_\                               
36   | |_\ /// HUBOT/\                             
37   |___///      /  \                            
38         \      /   +---+                            
39          \____/    |   |                            
40           | //|    +===+                            
41            //      |xx|                            
42
43npm ERR! code ENOENT
44npm ERR! syscall open
45npm ERR! path /home/vagrant/workspace/hubot-study/node_modules/body-parser/node_modules/inherits/package.json.3319719125
46npm ERR! errno -2
47npm ERR! enoent ENOENT: no such file or directory, open '/home/vagrant/workspace/hubot-study/node_modules/body-parser/node_modules/inherits/package.json.3319719125'
48npm ERR! enoent This is related to npm not being able to find a file.
49npm ERR! enoent 
50
51npm ERR! A complete log of this run can be found in:
52npm ERR!     /home/vagrant/.npm/_logs/2020-12-10T09_10_52_545Z-debug.log

作業中のディレクトリとその中身は以下のとおりです。

bash
1[vagrant@localhost hubot-study]$ pwd
2/home/vagrant/workspace/hubot-study
3[vagrant@localhost hubot-study]$ tree -L 1
4.
5├── Procfile
6├── README.md
7├── bin
8├── external-scripts.json
9├── hubot-scripts.json
10├── node_modules
11├── package.json
12└── scripts
13
143 directories, 5 files

/home/vagrant/workspace/hubot-study/package.jsonの中身はhubotにより生成されており、中身は以下のとおりです。

bash
1{
2  "name": "TestBot",
3  "version": "0.0.0",
4  "private": true,
5
6  "author": "kazu <kazuit@gmail.com>",
7
8  "description": "Test Bot",
9
10  "dependencies": {
11  },
12
13  "engines": {
14    "node": "0.10.x"
15  }
16}
17

それまでにやったことは、yoとgenerator-hubot, coffee-scriptの3つのモジュールのインストールとディレクトリの作成です。ここでは特にエラーは起きませんでした。また、ここまでの操作とyo hubotの実行は参考書通りに進めています。

bash
1[vagrant@localhost workspace]$ npm install -g yo@2.0.0
2[vagrant@localhost workspace]$ npm install -g generator-hubot
3[vagrant@localhost workspace]$ npm install -g coffee-script@1.12.7
4[vagrant@localhost workspace]$ mkdir hubot-study
5[vagrant@localhost workspace]$ cd hubot-study