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R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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Rを用いて「多重代入法で欠損値補完をしたのちに、GLM/GEEを行いたい」

Chloe.

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R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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投稿2020/11/25 12:42

R Studio version 1.3.1093を用いて統計解析を行なっています。
Rの使用については初心者で、参考書やネットで調べたのですが調べきれていなかったらごめんなさい。

前提・実現したいこと

データベース解析をするにあたって
①欠損値補完(多重代入法)
②GLM、可能であればGEEを行なって解析する
という2ステップをしたいです。

多重代入法をmice を使って行い、withで解析し、poolで統合するという手段が最適かと思って試みたのですが、lmは可能でもglmだとうまく解析できません。そして、本当はgeeがしたいです。

多重代入法のパッケージがmiceではないのを使った方がいいとか、glmのコードが間違っているのかとか解決法がわからなかったので質問させていただきました。

ここに質問の内容を詳しく書いてください。

library(mice)
imppt<- mice(selection_pt,
m=10,
maxit=50,
method="pmm",
printFlag=FALSE,
seed=500)
fit<- with(data = imppt,lm(motality~ISS+male))
pool(fit)
summary(pool(fit))

これは可能です。

発生している問題・エラーメッセージ

エラーメッセージ

lmではなくて、

fit1 <- with(data=imppt, glm(motality~ISS+male, family = binomial)

とすると

Error: Incomplete expression: fit1 <- with(data=imppt, glm(motality~ISS+male, family = binomial)

というエラーメッセージが出ます。

該当のソースコード

R

library(mice)
imppt<- mice(selection_pt,
m=10,
maxit=50,
method="pmm",
printFlag=FALSE,
seed=500)
fit1 <- with(data=imppt, glm(motality~ISS+male, family = binomial)

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投稿2020/11/25 14:46

KojiDoi

総合スコア13671

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Chloe.

2020/11/27 03:40

指摘していただきありがとうございます! 初歩的なことだとは思いますが、見落としていました。 カッコを加えたら、動作しました。 気をつけます。
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