301リダイレクトの設定をしても404になってしまいます。

前提・実現したいこと

ページ単位での301リダイレクトの設定を行ないたいと思います。
理由は旧サイトのランク引き継ぎの為です。

####前提
サイトのリニューアルで静的ページから動的ページになる為ＵＲＩの構造が変わります。
ドメインは変わりません。

####環境
旧サイトはウェブ、メール共にレンタルサーバー[ロリポップ]を利用しておりました
新サイトはメールのみレンタルサーバーを利用して、ウェブはVPSを利用し
旧サイトの設定でＡレコードを使ってVPSに向けて利用しております。

旧サイトはApache 新サイトはNginxを利用しております
ドメインはムームードメインでサービス内の設定でAレコードMXレコードを記述してサイトを振り分けております。

####サーバー構成

ロリポップを利用したことがなかったので、戸惑っているのですが
SSL化をする為に、ディレクトリが入れ子の構造になっております。
ルート/https/の中にルートと同じものが入っております。
そのため.htaccessもルートとhttpsの２つが存在する事になっております。

####やりたいこと
ページ単位で適切なページに振り分けたいと考えます

実現するために旧サイトの.htaccessにて
301リダイレクトの設定を行なったのですが、検索画面に表示される該当のページを確認すると
404の設定となってしまいます。

####ご教示頂きたい事
404が優先されているのか
それともAレコードでVPSを向いてしまっているのでNginx側で設定しなければならないのか
Nginx側で設定が出来るのでしたら、方法を教えて頂けますか。
よろしくお願い致します。

発生している問題・エラーメッセージ

301でページを振り分けているはずだが、404ページが返される。

該当のソースコード

####httpsディレクトリ.htaccess
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine on
RewriteBase /
RewriteCond %{REQUEST_URI} !(^/https/)
RewriteRule ^(.*)$ https://hogehoge.com/$1 [R=301,L]
</IfModule>

Redirect permanent /sample/sample.html https://hogehoge.com/contact/
.
.
.
Redirect permanent /quest/quest.html https://hogehoge.com/faq/

AddHandler php5.6-script html
php_flag short_open_tag On

####ルートディレクトリ.htaccess
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine on
RewriteBase /
RewriteCond %{REQUEST_URI} !(^/https/)
RewriteRule ^(.*)$ https://hogehoge.com/$1 [R=301,L]
RewriteRule? ^https://hogehoge.com/sample/sample.html$ https://hogehoge.com/contact/ [L,R=301]
</IfModule>

Redirect permanent /contact/contact.html https://hogehoge.com/contact/
.
.
.
Redirect permanent /quest/quest.html https://hogehoge.com/faq/
AddHandler php5.6-script html
php_flag short_open_tag On